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[综合交流] 请教文章中小分子结构中氢的展示问题

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楼主
请教下老师,某种药物的结构中含有氢原子,但是文献中作者在展示该药物与靶蛋白相互作用的时候,放的药物结构中不含氢原子,有点迷惑。而且,ligplot在作图的时候氢原子也是不显示的。所以想请教一下文章作图中的小分子结构的氢原子是否要显示出来呢?谢谢

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发表于 Post on 2021-11-8 23:06:44 | 只看该作者 Only view this author
这个完全随你。氢的数目通常比较多,都显示出来太乱,妨碍主体结构的观看,而且氢又不是关注的主要对象,所以往往隐去
但如果药物与靶点之间有氢键,这样的氢是绝对要显示出来的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-8 23:52:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-8 23:06
这个完全随你。氢的数目通常比较多,都显示出来太乱,妨碍主体结构的观看,而且氢又不是关注的主要对象,所 ...

谢谢老师,还有就是 在展示成氢键的氢同时非极性氢可以隐藏吗?还是均显示出来?

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发表于 Post on 2021-11-8 23:52:47 | 只看该作者 Only view this author
5撇到3撇 发表于 2021-11-8 23:52
谢谢老师,还有就是 在展示成氢键的氢同时非极性氢可以隐藏吗?还是均显示出来?

可以,图题里注明这点即可
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-8 23:55:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-11-8 23:52
可以,图题里注明这点即可

明白谢谢老师!

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