关于分子晶体的均一介质建模问题

Ewald天下第一! · 发表于 Post on 2021-11-20 14:27:44

请问大家，我最近在进行分子晶体的相变模拟。然后通过文献调研，发现很多烷烃其实是有分子晶体结构的。然后他在固体形式会以类似于多晶体的结构一小块一小块的聚合在一起。如图B所示。我之前在建模时使用的方法都是，直接建出来分子晶体然后超胞成完美晶体，然后放在高于熔点的NPT系综下跑，就可以得到A的结构。但是，如果我想要通过MS直接实现B的结构应该用什么功能？
另外我尝试过先把完美的超胞晶体融化再凝固，但是发现并不能回到初始的晶体结构，这是否合理？是不是我的力场参数有问题？我的师兄和我说无法回去的原因是：由于等概率假设，我的系统有非常大的自由度，最终他只能回到确定N P T系综下的某一个状态下，并不能回到我想要的唯一状态。

get-it · 发表于 Post on 2021-11-21 21:19:48

解决第一个问题需要晶体结构预测方法。
另外，你师兄说的没错。

Ewald天下第一! · 发表于 Post on 2021-11-23 18:08:29

get-it 发表于 2021-11-21 21:19
解决第一个问题需要晶体结构预测方法。
另外，你师兄说的没错。

我看那篇文章的作者应该是没考虑晶体结构的，只是为了表示这种各向同性的形式。如果具体建模这个要怎么操作啊，我能想到的方法就是复制选择粘贴，但是太不现实了

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