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[NBO相关] 做NPA电荷分析问题求助

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首次接触到电荷分析领域,计算时写了pop=npa,但输出文件不知道怎么看,求指导。

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发表于 Post on 2021-11-22 14:44:26 | 只看该作者 Only view this author
输出文件中Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge那一列就是NPA电荷
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-22 16:13:37 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-11-22 14:44
输出文件中Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge那一列就是NPA电荷

找到了,谢谢指导

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发表于 Post on 2021-12-20 19:30:32 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-11-22 14:44
输出文件中Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge那一列就是NPA电荷

老师,您好!我的输出文件中关于Summary of Natural Population Analysis那部分出现了三次,另外我用gaussview打开输出文件查看NBO的电荷分布,原子上显示的电荷数是我输出文件里第一次出现Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge的那一列。我不太清楚NPA电荷应该看输出文件中算的第一次还是第三次

捕获.PNG (17.89 KB, 下载次数 Times of downloads: 42)

捕获.PNG

2-BPA-Co-N4-Graphene(1).log

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发表于 Post on 2021-12-20 19:40:38 | 只看该作者 Only view this author
Hear 发表于 2021-12-20 19:30
老师,您好!我的输出文件中关于Summary of Natural Population Analysis那部分出现了三次,另外我用gaus ...

这是由于你算的是开壳层体系,输出的三次分别是基于总密度做的分析、基于alpha电子密度做的分析、基于beta电子密度的。第二者的贡献+第三者的贡献等于第一者的值,即后两个是第一个的组成部分。

如果你仅需要某个原子上的NPA电荷,就看基于总密度做分析算出的结果即可。
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发表于 Post on 2021-12-20 20:39:08 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-12-20 19:40
这是由于你算的是开壳层体系,输出的三次分别是基于总密度做的分析、基于alpha电子密度做的分析、基于bet ...

明白啦,非常感谢老师的回答

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发表于 Post on 2024-5-23 16:41:49 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-12-20 19:40
这是由于你算的是开壳层体系,输出的三次分别是基于总密度做的分析、基于alpha电子密度做的分析、基于bet ...

老师我想请教一下,我做福井函数的时候是计算NPA0、NPA+1、NPA-1三种,然后算出来Summary of Natural Population Analysis代入福井函数公式,得出亲核亲电自由基三种进攻位点,我的NPA0文件中可以找到您说的这三次Summary of Natural Population Analysis,但是我在NPA+1和-1文件中各能找到九次,那我在计算时应该选取哪一次的Summary of Natural Population Analysis呢?

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发表于 Post on 2024-5-23 16:44:14 | 只看该作者 Only view this author
这是我计算NPA电荷时的gjf和out文件,希望老师能看一下

dmp福井函数.zip

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发表于 Post on 2025-7-14 17:58:21 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-11-22 14:44
输出文件中Summary of Natural Population Analysis:下方表格里Natural Charge那一列就是NPA电荷

请问计算NPA的关键词是什么?需要结构优化吗

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发表于 Post on 2025-7-14 18:37:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2025-7-14 18:39 编辑
zhangxinxin 发表于 2025-7-14 17:58
请问计算NPA的关键词是什么?需要结构优化吗

关键词是pop=NPA,这个帖子一开头提问的人就说了。是否需要结构优化 看研究问题/分析目的而定。打个比方,你问我下一顿饭要不要用刀叉,我不知道你要吃中餐、西餐还是什么手抓饭,自然就没法回答你要不要用刀叉。
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发表于 Post on 2025-7-14 19:14:36 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2025-7-14 18:37
关键词是pop=NPA,这个帖子一开头提问的人就说了。是否需要结构优化 看研究问题/分析目的而定。打个比方 ...

好的谢谢,那如果是闭壳层的话还需要写关键词pop=full吗?

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发表于 Post on 2025-7-14 19:53:26 | 只看该作者 Only view this author
zhangxinxin 发表于 2025-7-14 19:14
好的谢谢,那如果是闭壳层的话还需要写关键词pop=full吗?

我不知道你是否看错了帖子、还是回复错了帖子。无论体系是闭壳层/开壳层,获取NPA电荷只需要关键词pop=NPA,都不需要pop=full
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发表于 Post on 2025-7-14 20:23:46 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2025-7-14 19:53
我不知道你是否看错了帖子、还是回复错了帖子。无论体系是闭壳层/开壳层,获取NPA电荷只需要关键词pop=NP ...

是不是算闭壳层的CDA电荷才需要加pop=full?

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发表于 Post on 2025-7-15 06:20:36 | 只看该作者 Only view this author
zhangxinxin 发表于 2025-7-14 20:23
是不是算闭壳层的CDA电荷才需要加pop=full?

根本没有叫CDA电荷的东西

如果你是指CDA分析,对于Gaussian用户强烈建议直接基于fch文件做,完全不需要pop=full,仔细看下文
使用Multiwfn做电荷分解分析(CDA)、绘制轨道相互作用图
http://sobereva.com/166
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2025-7-15 16:09:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-7-15 06:20
根本没有叫CDA电荷的东西

如果你是指CDA分析,对于Gaussian用户强烈建议直接基于fch文件做,完全不需 ...

您好请问是基于结构优化后的fchk文件做还是直接单点能优化的fchk文件?然后可以直接用multifn做吗?

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