求教氢氧生成水过渡态问题

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-24 17:07:17

本帖最后由 y1p1p1 于 2021-11-25 11:06 编辑

各位老师好，我想请教下氢气和氧气反应生成水的反应求过渡态，反应物和产物要怎么设置，我尝试了下两个氢分子，氧分子和两个水分子的组合还有氢分子，氧分子和一个水分子，一个氧原子的组合，都不太行，想请教下应该怎么操作
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最后出来的是这个结果

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-11-24 17:17:12

这个反应不是基元反应，只有基元反应才能直接找过渡态。它是自由基链式反应，光拿几个分子放在一起摆是不行的。
建议搜一下研究H2和O2反应的综述，每一步机理都会告诉你，你再照着文献分别计算每一步基元反应

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-24 17:27:12

wzkchem5 发表于 2021-11-24 17:17
这个反应不是基元反应，只有基元反应才能直接找过渡态。它是自由基链式反应，光拿几个分子放在一起摆是不行 ...

好的好的，谢谢老师

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-25 10:40:11

wzkchem5 发表于 2021-11-24 17:17
这个反应不是基元反应，只有基元反应才能直接找过渡态。它是自由基链式反应，光拿几个分子放在一起摆是不行 ...

老师你好，我今天用基元反应试了一下，在氢气分子分解为两个氢原子这一步就卡住了Unable to bracket maximum from both endpoints Please check endpoints我想可能是氢原子和氢气分子之间差了一个H-H键的键能，能量一直降低，好像不太行。我本来想可不可以用氢原子生成氢气分子，可是我这要计算能垒，好像不太行

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-25 10:42:55

y1p1p1 发表于 2021-11-25 10:40
老师你好，我今天用基元反应试了一下，在氢气分子分解为两个氢原子这一步就卡住了Unable to bracket maxi ...

我刚刚用氢原子生成氢气分子也不行。。。

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-11-25 10:59:50

y1p1p1 发表于 2021-11-25 10:42
我刚刚用氢原子生成氢气分子也不行。。。

计算级别，输入文件啥都没给。估计你也没考虑对称破缺波函数。
看《在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚》http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-25 11:08:19

zjxitcc 发表于 2021-11-25 10:59
计算级别，输入文件啥都没给。估计你也没考虑对称破缺波函数。
看《在网上求助计算化学问题的时候必须把 ...

刚着手，这些名词也看不懂其实。。。

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-25 14:58:03

zjxitcc 发表于 2021-11-25 10:59
计算级别，输入文件啥都没给。估计你也没考虑对称破缺波函数。
看《在网上求助计算化学问题的时候必须把 ...

老师有ms计算过渡态的相关资料可以推荐嘛，之前看过社长发的过渡态的文章，可是具体操作还是不明白

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-11-25 15:15:12

本帖最后由 zjxitcc 于 2021-11-25 15:17 编辑

y1p1p1 发表于 2021-11-25 14:58
老师有ms计算过渡态的相关资料可以推荐嘛，之前看过社长发的过渡态的文章，可是具体操作还是不明白

小分子计算and新手入门，这两种情况叠加 -> 毫无疑问应该用Gaussian软件作为入门，不会有人去用昂贵的Dmol3或M$ 。

仅考虑一个H2分子时，H-H共价键断裂是没有过渡态的（你也可以说成成键的过渡态不存在，TS本身不区分成键、断键方向，是同一个TS），能量随着键长增长会一直上升，最终趋于一个稳定值。你直接提交六、七个不同键长的单点计算任务，画出势能曲线，一目了然。“最终趋于一个稳定值”需要考虑对称破缺才能算出来，否则能量可能会一直上升。

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-25 15:31:12

zjxitcc 发表于 2021-11-25 15:15
小分子计算and新手入门，这两种情况叠加 -> 毫无疑问应该用Gaussian软件作为入门，不会有人去用昂贵的Dmo ...

因为ms上面没有Gaussian的教程，我是跟着教程走的，我去瞅瞅怎么用

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-11-25 16:04:07

y1p1p1 发表于 2021-11-25 08:31
因为ms上面没有Gaussian的教程，我是跟着教程走的，我去瞅瞅怎么用

高斯的教程当然要看高斯的官网，不能啥都看MS。。。
http://gaussian.com/keywords/

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-25 16:17:59

wzkchem5 发表于 2021-11-25 16:04
高斯的教程当然要看高斯的官网，不能啥都看MS。。。
http://gaussian.com/keywords/

老师让用ms做模拟，不过这里也有Gaussian模块。还想请教下我通过过渡态计算活化能没问题的吧。。。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-11-25 16:49:35

y1p1p1 发表于 2021-11-25 09:17
老师让用ms做模拟，不过这里也有Gaussian模块。还想请教下我通过过渡态计算活化能没问题的吧。。。

对于有过渡态的反应，可以用过渡态计算活化能，对于没有过渡态的反应不行

y1p1p1 · 发表于 Post on 2021-11-25 20:43:29

wzkchem5 发表于 2021-11-25 16:49
对于有过渡态的反应，可以用过渡态计算活化能，对于没有过渡态的反应不行

好的，谢谢老师

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