求助：amber14在tleap过程中如何添加Mg2+参数

fuchg · 发表于 Post on 2021-11-24 19:48:11

本帖最后由 fuchg 于 2021-11-24 19:51 编辑

各位老师，本人使用amber14中的tleap程序生成拓扑文件和坐标文件时出现报错，提示没有Mg2+参数，我查找了一下发现网上没有如何添加Mg2+参数的，想请教各位老师该如何添加Mg2+参数呢？

还想请假各位老师，我的体系中包含一个ADP和一个小分子，我都使用小分子参数生成方法生成.frcmod并导入，请问这样合理吗？

rpestana94 · 发表于 Post on 2021-11-24 22:35:33

You can download parameters from this website http://amber.manchester.ac.uk/, there are parameter for Mg and for ADP too.

fuchg · 发表于 Post on 2021-11-25 09:56:32

rpestana94 发表于 2021-11-24 22:35
You can download parameters from this website http://amber.manchester.ac.uk/, there are parameter fo ...

谢谢老师

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