计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 6027|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 求助:CP2K中使用界面模型(加真空层),如果需要考虑热膨胀,是选择NPT还是NVT系综?

[复制链接 Copy URL]

71

帖子

0

威望

356

eV
积分
427

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
CP2K模拟界面或表面模型时,三维周期或者Z方向非周期的话,考虑热膨胀,是使用NVT还是NPT系综比较好?如果选的是三维周期+真空层模拟NPT可行吗?

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120169

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2021-11-26 11:36:35 | 只看该作者 Only view this author
热膨胀当然得NPT,要不然盒子尺寸都不变怎么体现晶胞的膨胀
平行于界面方向考虑周期性,垂直的方向不考虑周期性
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

71

帖子

0

威望

356

eV
积分
427

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-26 21:15:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 XWH 于 2021-11-26 21:17 编辑
sobereva 发表于 2021-11-26 11:36
热膨胀当然得NPT,要不然盒子尺寸都不变怎么体现晶胞的膨胀
平行于界面方向考虑周期性,垂直的方向不考虑 ...

您好,请问一下,如果在使用NPT-I且Z方向非周期时,出现Stress Tensor not tested for 2D systems,这种错误的话,我应该在STRESS_TENSOR 使用那种方式比较好点?或者应该是其他什么方法消除这种问题?
出现错误时使用的代码如下:
&FORCE_EVAL
STRESS_TENSOR ANALYTICAL
  METHOD Quickstep
  &SUBSYS
    &CELL
      A     5.82640000     0.00000000     0.00000000
      B    -2.92121033     5.04117716     0.00000000
      C     0.00000000     0.00000000    19.72530000
          ALPHA_BETA_GAMMA 90 90 120.0910
      PERIODIC XY #Direction of applied PBC (geometry aspect)
……
&POISSON
      PERIODIC XY #Direction(s) of PBC for calculating electrostatics
      PSOLVER ANALYTIC #The way to solve Poisson equation
    &END POISSON

236

帖子

1

威望

3805

eV
积分
4061

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2021-11-27 09:47:36 | 只看该作者 Only view this author
XWH 发表于 2021-11-26 21:15
您好,请问一下,如果在使用NPT-I且Z方向非周期时,出现Stress Tensor not tested for 2D systems,这种 ...

https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/FORCE_EVAL.html考虑一下PSOLVER参数

71

帖子

0

威望

356

eV
积分
427

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-28 00:03:40 | 只看该作者 Only view this author
wolfli369 发表于 2021-11-27 09:47
https://manual.cp2k.org/trunk/CP2K_INPUT/FORCE_EVAL.html考虑一下PSOLVER参数

感谢!

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120169

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2022-3-17 07:24:46 | 只看该作者 Only view this author
XWH 发表于 2021-11-26 21:15
您好,请问一下,如果在使用NPT-I且Z方向非周期时,出现Stress Tensor not tested for 2D systems,这种 ...

照常用三维周期性优化,但Z方向通过&CELL_OPT里的CONSTRAINT Z固定尺寸保证真空区的存在。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-16 21:59 , Processed in 0.160337 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list