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[并行运算] 购置了一台廉价双CPU计算机,计算的时候cpu没办法拉满

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本人严格按照公社sob的配置购置了一台双cpu的计算机,想进行一点简单的计算。算了一个原子数70左右的大碳片,算了三天还没有算完,cpu好像只有一个在工作。我想停止计算,停止计算之后除了要设置scf=noincore 之外,是否还需要在控制面板里设置cpu个数和内存呢?内存需要设置多少比较合适?本人第一次用双cpu的,周围人也没有用过这种,求解决

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小屁孩

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发表于 Post on 2021-11-25 16:01:02 | 只看该作者 Only view this author
改什么系统配置,真离谱。Gaussian输入文件只设置了12线程,当然不能调用满24个物理核心。输入文件应该写%nprocshared=24。另,生产力计算最好用LINUX操作系统
- 向着虚无前进 -

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3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-11-25 16:05:32 | 只看该作者 Only view this author
Entropy.S.I 发表于 2021-11-25 16:01
改什么系统配置,真离谱。Gaussian输入文件只设置了12线程,当然不能调用满24个物理核心。输入文件应该写%n ...

好的我试试

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发表于 Post on 2021-11-25 16:32:49 | 只看该作者 Only view this author
g09使用12核心以上都是想多了。

无论是g09/g16,
使用微软系统,都是喝多了。
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发表于 Post on 2021-11-25 17:18:56 | 只看该作者 Only view this author
要么虚拟机,要么换LINUX吧;win下的生产力真的很慢
I AM an Amphibious Warrior.

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发表于 Post on 2021-11-26 09:17:56 | 只看该作者 Only view this author
windows下用了12个核?怎么做到的?

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7#
发表于 Post on 2021-11-26 09:45:54 | 只看该作者 Only view this author
aaq2800 发表于 2021-11-26 09:17
windows下用了12个核?怎么做到的?

win64版本的

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发表于 Post on 2021-11-26 11:47:46 | 只看该作者 Only view this author
对于主流双路服务器,用windows版Gaussian完全是糟蹋CPU。必须用Linux版Gaussian,要么实体系统上跑,要么VMware虚拟机里跑,要么WSL里跑,都远比用Windows版快得多得多
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-11-26 12:24:39 | 只看该作者 Only view this author
我看了一下,E5-2678v3只有12个核心,两个24个核心。图里有48个框,明显是开了超线程了。
实际情况是两个CPU都占满了。超线程超出来的核不能当作真的核来用。

所以对于多人用的服务器,还是建议管理员把超线程关掉。用服务器的人大多数情况下不知道把超出来的核空着,而是有多少用多少。那点增益抵偿不了超过物理核数导致的性能损失,还容易搞得组里人际关系紧张。

隔壁组就因为这事闹过不少矛盾。他们的服务器不仅开超线程,还掰碎了给好几个人用,每人分4-8个核。结果就是大家的任务都跑得很慢。管理员滥用职权,杀别人任务跑自己的。普通用户用脚本全天盯梢,一有空余就自动提交任务。玩出内卷了属于是。

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发表于 Post on 2021-11-26 14:55:08 | 只看该作者 Only view this author
有感于楼上说的“抢资源事宜”.

应对这种事情, 安装一个调度管理器就解决问题了.

所有的计算均通过脚本自动加载....

再配合一个脚本, 不是队列里面的分派的进程, 全都杀死...
然后世界就清净了... 资源也可以合理利用了....
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发表于 Post on 2021-11-26 19:01:58 | 只看该作者 Only view this author
万里云 发表于 2021-11-26 12:24
我看了一下,E5-2678v3只有12个核心,两个24个核心。图里有48个框,明显是开了超线程了。
实际情况是两个C ...

如abin老师所说,其实装一个资源调度器就行了,SLURM、BPS之类的,就是需要集群管理员费点功夫去设置。没经验设置起来还挺难受。

设置好每个节点多少核就只能申请到多少核,脚本提交排队就是了。

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