绘制 Energy Profile 的小工具 2.0

exity · 发表于 Post on 2017-9-8 06:14:53

awesome

shx · 发表于 Post on 2017-9-8 18:03:10

多谢楼主，非常实用。
我最近一直在用的是MagicPlot这个软件，有学术版本，免费的，用起来也很容易，也推荐一下。

steven · 发表于 Post on 2017-9-8 19:23:55

刚好需要,看到此帖.
谢谢

xiaoma0417 · 发表于 Post on 2017-9-10 12:08:34

学习了，谢谢

chw985550192 · 发表于 Post on 2017-10-31 19:45:18

您好，我在edit修改width的时候，只有一个横线变了，其他的为啥不变化，谢谢

哈哈哈 · 发表于 Post on 2019-5-10 08:52:59

老师，我有个小问题想问问你怎么处理的：示例中CP3是TS2的产物，从TS2走IRC得到CP3，从而可以计算一个CP3的能量。TS3走IRC得到其相应的反应物（以CP3-0表示吧），也可以计算其相应的能量。由于加了9，那么CP3-0和CP3体系的原子数不同能量变化应该有点大，想问这里是怎么处理的将CP3-0和CP3最终以CP3表示（体系原子数不同，怎么合并的。我做的也涉及到这个，我想做一个总的图，但会涉及原子数不同和催化的环境不同，不知道怎么合并合适）？谢谢哈

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2019-5-10 10:31:36

哈哈哈发表于 2019-5-10 08:52
老师，我有个小问题想问问你怎么处理的：示例中CP3是TS2的产物，从TS2走IRC得到CP3，从而可以计算一个CP3的 ...

一个势能面上各个态的原子数必须是一样的，如果不一样应该配平，比如这里CP3之前其实应该相当于每一个态都加上一个孤立的化合物9的能量。

在考虑上述问题的基础上，如果CP3-0的自由能比CP3高，则只画CP3，否则，如果画的开/差的多，两个都画上，这说明CP3与PPh3会形成稳定的复合物，CP3-0单独画成一个态是合理的；如果CP3-0比CP3低，并且只能画下一个，只画CP3-0，因为下一步的活化自由能是从稳定的复合物开始算的。

哈哈哈 · 发表于 Post on 2019-5-10 11:03:40

liyuanhe211 发表于 2019-5-10 10:31
一个势能面上各个态的原子数必须是一样的，如果不一样应该配平，比如这里CP3之前其实应该相当于每一个态 ...

好的谢谢你

pinkshu · 发表于 Post on 2021-4-16 15:28:55

太赞了

tsingjm · 发表于 Post on 2021-5-15 11:15:22

harpia · 发表于 Post on 2021-6-4 20:05:06

感谢！

mengyu0007 · 发表于 Post on 2022-4-17 13:22:43

感谢分享，最近一直在找

笃定 · 发表于 Post on 2024-11-11 21:29:58

感谢分享！

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