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[GROMACS] 求助remd蛋白质交换步长问题

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楼主
在做蛋白质remd中使用的交换步长是0.2ps 得到的交换律特别的大。该成1ps就正常了
我在网站上看到说“研究表明对于蛋白质交换步长应大于1ps”,这句话的研究依据在哪里能找到(文献),另外remd的原理有没有专门讲述的文章,我自己没有找到?

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发表于 Post on 2021-12-7 06:06:29 | 只看该作者 Only view this author
给你两篇REMD介绍文章,搞清楚原理再做

Extracted from methods in Enzymology vol-383.pdf (244.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 14)

Replica Exchange Molecular Dynamics-A Practical Application Protocol with Soluti.pdf (578.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-8 10:07:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-7 06:06
给你两篇REMD介绍文章,搞清楚原理再做

谢谢老师

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