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[新手求助] 求助:使用Gauss优化碳中心一氯代醌自由基后结构被优化为五元环如何解决

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本帖最后由 小黑匣 于 2021-12-21 16:49 编辑

在GaussView里绘制输入文件如图1(CBQ-OH-1)所示,使用B3LYP/CBSB7,关键词为opt freq做优化结构和频率计算。用Gauss算完得出的优化结构却是被开环的五元环,如图2(CBQ-OH-41)所示。请问这种情况如何解决?怎样得到贴合实际的碳中心一氯代醌自由基的结构?

CBQ-OH-1.jpg (218.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

优化前结构

优化前结构

CBQ-OH-41.jpg (188.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

优化后结构

优化后结构

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发表于 Post on 2021-12-21 17:25:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mfdsrax2 于 2021-12-21 17:26 编辑

为什么上面那个碳原子没有氢,是卡宾吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-21 17:56:36 | 只看该作者 Only view this author
mfdsrax2 发表于 2021-12-21 17:25
为什么上面那个碳原子没有氢,是卡宾吗

是碳中心的自由基

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发表于 Post on 2021-12-21 18:41:15 | 只看该作者 Only view this author
不要用非主流基组

如果你直接用0 1以常规方式当闭壳层算的,大概率得到的波函数不是真正稳定波函数,而且也根本不可能是你所谓的碳中心自由基。先用stable关键词对初始结构收敛到的波函数进行稳定性测试,如果都不稳定,之后的计算毫无意义。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-21 19:18:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-21 18:41
不要用非主流基组

如果你直接用0 1以常规方式当闭壳层算的,大概率得到的波函数不是真正稳定波函数,而 ...

好的,谢谢sob老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-21 20:59:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-21 18:41
不要用非主流基组

如果你直接用0 1以常规方式当闭壳层算的,大概率得到的波函数不是真正稳定波函数,而 ...

老师,我改用6-311G**,并且改为0 2计算,结果仍不理想,一下就计算结束了。那请问我想得到优化结构后的碳中心自由基应该怎么做呢?

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发表于 Post on 2021-12-21 22:57:33 | 只看该作者 Only view this author
如果不是卡宾的话,你这个应该设置为三重态,再用stable测下波函数稳定性。

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发表于 Post on 2021-12-22 00:56:19 | 只看该作者 Only view this author
小黑匣 发表于 2021-12-21 20:59
老师,我改用6-311G**,并且改为0 2计算,结果仍不理想,一下就计算结束了。那请问我想得到优化结构后的 ...

不要用什么“一下就计算结束了”这种莫名其妙的描述
都说了,先检测波函数稳定性再说,难道我的回复里只让你改基组了?
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-22 08:53:14 | 只看该作者 Only view this author
joeson 发表于 2021-12-21 22:57
如果不是卡宾的话,你这个应该设置为三重态,再用stable测下波函数稳定性。

好的,谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-12-22 08:53:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-12-22 00:56
不要用什么“一下就计算结束了”这种莫名其妙的描述
都说了,先检测波函数稳定性再说,难道我的回复里只 ...

明白了,谢谢老师

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