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[Multiwfn使用咨询] 关于Linux中计算表面静电势分布的ESPpt.sh不能正常执行的问题

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本帖最后由 hong1kun 于 2021-12-30 16:40 编辑

问题: ESPpt.sh脚本为何不能直接执行? (系统: Ubuntu20.04, 软件: Multiwfn3.8)

目标:
仿照http://sobereva.com/443和Multiwfn3.8的帮助手册进行操作,以获得产生分子结构和表面顶点的pdb文件。(ESPpt.sh文件来源于/Multiwfn_3.8_dev_bin_Linux/examples/drawESP)
操作: 给予执行ESPpt.sh权限,输入命令./ESPpt.sh并回车,弹出以下错误(没有那个文件或目录)


解决: 如果逐行输入ESPpt.sh(如下)的命令则没有上述错误,或者在winscp下删除该sh脚本的部分内容并重新保存,就可以正常执行该脚本。
问题分析: 个人怀疑可能是类似换行符号等文本格式的原因导致ESPpt.sh脚本文件无法正常执行。

ESPpt.sh内容
Multiwfn 1.fchk < ESPpt.txt
mv -f vtx.pdb vtx1.pdb
mv -f mol.pdb mol1.pdb
Multiwfn 2.fchk < ESPpt.txt
mv -f vtx.pdb vtx2.pdb
mv -f mol.pdb mol2.pdb
Multiwfn 3.fchk < ESPpt.txt
mv -f vtx.pdb vtx3.pdb
mv -f mol.pdb mol3.pdb
Multiwfn 4.fchk < ESPpt.txt
mv -f vtx.pdb vtx4.pdb
mv -f mol.pdb mol4.pdb

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发表于 Post on 2021-12-30 16:46:56 | 只看该作者 Only view this author
如果怀疑是换行符问题,运行之前用dos2unix转化一下
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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发表于 Post on 2022-6-7 21:32:20 | 只看该作者 Only view this author
朋友你好,我也遇到同样的问题,但始终无法解决,来请教下后来你是如何解决的呢,谢谢!

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发表于 Post on 2022-6-17 19:43:15 | 只看该作者 Only view this author
NUAAcxk 发表于 2022-6-7 21:32
朋友你好,我也遇到同样的问题,但始终无法解决,来请教下后来你是如何解决的呢,谢谢!

甭调用cubegen,没好处

Multiwfn使用的高效的静电势算法的介绍文章已于PCCP期刊发表!
http://sobereva.com/614http://bbs.keinsci.com/thread-24940-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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