一篇文章里的vibrational density of states(VDOS)计算方法的疑问

flyingchow · 发表于 Post on 2022-1-12 11:24:23

今天我读到一篇文献
https://www.nature.com/articles/s42004-021-00540-z

这篇文献介绍了各种fullerene一直延展到graphene的振动分析，计算VDOS的方法(作者假定graphene就是fullerene直径无穷大的情况），作者还提出了一个Z-VDOS，就是在分子XY平面外的振动频率分析。下图中红色的就是Z-VDOS。请问老师们以前有计算过类似谱图的经验吗？
有没有现成的脚本或者程序能把Z-VDOS（平面外的振动频率）单独分出来？谢谢。

sobereva · 发表于 Post on 2022-1-12 12:06:54

最近几天我在Multiwfn里加入个绘制振动DOS的功能

flyingchow · 发表于 Post on 2022-1-13 01:59:20

sobereva 发表于 2022-1-12 12:06
最近几天我在Multiwfn里加入个绘制振动DOS的功能

谢谢老师了!老师能稍微介绍一下这个振动DOS分出“平面外”振动的分峰方法吗？我研究半天，也不知道该怎么分析振动频率的方向。

get-it · 发表于 Post on 2022-1-13 02:48:26

估计是把简正模和z方向的点乘（或者平方）作为系数吧

flyingchow · 发表于 Post on 2022-1-13 03:15:48

get-it 发表于 2022-1-13 02:48
估计是把简正模和z方向的点乘（或者平方）作为系数吧

文献里给了计算方式，无奈我还是不会搞。这个公式中的delta是啥我也不知道。

sobereva · 发表于 Post on 2022-1-13 08:17:35

flyingchow 发表于 2022-1-13 01:59
谢谢老师了!老师能稍微介绍一下这个振动DOS分出“平面外”振动的分峰方法吗？我研究半天，也不知道该怎么 ...

gview里看振动动画，或者自己写个程序，根据Gaussian输出的振动矢量是否Z分量都为0来判断

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[综合交流] 一篇文章里的vibrational density of states(VDOS)计算方法的疑问

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