acpype.py产生拓扑文件出错

qq1020935287 · 发表于 Post on 2022-1-23 14:43:34

各位老师好，我在用acpype生成GMX拓扑文件时报这个错，查到又说是ambertools版本的问题，但是这报错并不是一直出现，偶尔正确生成，请问应该如何处理
| ACPYPE: AnteChamber PYthon Parser interfacE v. 0 0 Rev: 0 (c) 2022 AWSdS |
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WARNING: no 'babel' executable, no PDB file as input can be used!
ACPYPE FAILED: [Errno 2] No such file or directory: 'tmp'
Total time of execution: less than a second

qq1020935287 · 发表于 Post on 2022-1-23 14:47:59

mol2文件如附件所示

二饼妹 · 发表于 Post on 2022-1-23 16:31:58

qq1020935287 发表于 2022-1-23 14:47
mol2文件如附件所示

mol2里Ar改成ar

qq1020935287 · 发表于 Post on 2022-1-23 17:12:11

二饼妹发表于 2022-1-23 16:31
mol2里Ar改成ar

太感谢您了！预祝您新春快乐！

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[GROMACS] acpype.py产生拓扑文件出错

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