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[新手求助] 关于限制性优化虚频及过渡态问题

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楼主
在找过渡态的过程中,由于一直找不到过渡态,所以了限制甲酸分子上的羟基跟硫酸根的氧,但是优化出来的过渡态有三个虚频。然后我解除限制优化新出的结构之后一直也优化不出来,不知是什么原因?是因为我的过渡态找的不对吗?附件中是我优化的结构以及输入文件和输出文件。非常感谢

DFT TS1.zip

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发表于 Post on 2022-1-24 19:09:44 | 只看该作者 Only view this author
可以做一个柔性扫描看看是不是无垒反应
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-1-24 19:57:35 | 只看该作者 Only view this author
1)可以按照不想要的虚频的方向拨动一下再做限制性优化吧
2)氧加弥散或许会有帮助
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2022-1-25 10:27:16 | 只看该作者 Only view this author
最后找过渡态应该放开键长限制啊?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-27 01:41:12 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-1-24 19:09
可以做一个柔性扫描看看是不是无垒反应

是一个从甲酸上拿氢的反应,感觉应该不是无垒反应,我做一下柔性扫描看看,非常感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-27 01:41:50 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2022-1-24 19:57
1)可以按照不想要的虚频的方向拨动一下再做限制性优化吧
2)氧加弥散或许会有帮助

好的,我调整一下结构和方法试试,非常感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-1-27 01:44:06 | 只看该作者 Only view this author
gauss98 发表于 2022-1-25 10:27
最后找过渡态应该放开键长限制啊?

本打算是先找到大致的结构,再放开限制进行优化,放开限制之后也难以找到过渡态。

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发表于 Post on 2025-9-29 19:45:14 | 只看该作者 Only view this author
LZLLLL 发表于 2022-1-27 01:44
本打算是先找到大致的结构,再放开限制进行优化,放开限制之后也难以找到过渡态。

遇到了一样的情况,限制性优化有虚频放开限制后,虚频消失了。

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