计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3718|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[综合交流] 求助团簇上OH基团的pKa分析

[复制链接 Copy URL]

269

帖子

1

威望

3030

eV
积分
3319

Level 5 (御坂)

计算了一个过渡金属氧化物团簇上不同OH基团的pKa,比较顺序,得到的结果和文献里的实验结果不一致(实验结果也不是直接测的而是根据经验间接推断),想做些进一步的分析,不知道该从哪儿入手。我的计算方法很简单,就是拔掉不同OH上的质子然后比较各个阴离子的能量来算相对pKa(只是想知道不同OH基团pKa的相对顺序而非绝对值),阴离子能量越低说明对应的酸性越强,pKa越小。气相和隐式溶剂都试了,顺序是一样的。试着看了一下不同OH基团的O-H键长和键级,但差别不大,不好得出结论。不知道从电子结构/波函数角度有哪些分析可以做?谢谢!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2022-2-9 10:12:07 | 只看该作者 Only view this author
用Multiwfn计算静电势,比如



也可以用离去的质子的Hirshfeld电荷等描述符讨论
参考比如
Journal of Computational Chemistry 2018, 39, 117–129

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

269

帖子

1

威望

3030

eV
积分
3319

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-10 08:38:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-8 20:12
用Multiwfn计算静电势,比如

静电势的结果和算出来的pKa是相反的,反而和之前实验经验推断的一致...所以就是说这几个位点的pKa并不是完全由静电作用决定,而是另有原因?我能想到的可能性是拔掉不同质子后结构弛豫带来的能量变化不同?好像有点牵强

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2022-2-10 10:05:43 | 只看该作者 Only view this author
agent99 发表于 2022-2-10 08:38
静电势的结果和算出来的pKa是相反的,反而和之前实验经验推断的一致...所以就是说这几个位点的pKa并不是 ...

没细节没法说,也考虑是否理论计算的pKa其实有问题。
建议先和真空下pKa计算结论做个对比,因为溶剂效应的考虑可能会导致结论发生很大改变,亦可能给计算的能量引入很大误差。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 21:30 , Processed in 0.261368 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list