小分子接在二氧化钛上进行优化时为什么会全部混淆在一起了？，

min · 发表于 Post on 2016-3-2 14:57:44

在做分子优化时，小分子接在二氧化钛晶包上，原本只需要优化成最佳的连接方式，结果却使分子和二氧化钛晶包完全混合了，这是怎么回事？该怎么办？

卡开发发 · 发表于 Post on 2016-3-2 15:02:46

1、怎么建立的模型？
2、什么程序算的，用的怎样的参数？
3、优化后的结果具体如何？

上述三个问题很难脑补

min · 发表于 Post on 2016-3-2 15:35:22

卡开发发发表于 2016-3-2 15:02
1、怎么建立的模型？
2、什么程序算的，用的怎样的参数？
3、优化后的结果具体如何？

用的GaussView建立的模型，高斯09程序计算，图片已截下来了

卡开发发 · 发表于 Post on 2016-3-2 16:17:56

min 发表于 2016-3-2 15:35
用的GaussView建立的模型，高斯09程序计算，图片已截下来了

不知道是不是与TiO2团簇截取大小以及边界处理的合理性相关，团簇太小可能很不容易稳定。

min · 发表于 Post on 2016-3-2 16:58:31

卡开发发发表于 2016-3-2 16:17
不知道是不是与TiO2团簇截取大小以及边界处理的合理性相关，团簇太小可能很不容易稳定。

一开始我也认为是这样的问题，用了更大的团簇，结果还是混淆在一起了，我查了一下有说是键之间不饱和引起的互相作用，请问有什么办法解决吗？

卡开发发 · 发表于 Post on 2016-3-2 17:33:56

本帖最后由卡开发发于 2016-3-2 18:38 编辑

min 发表于 2016-3-2 16:58
一开始我也认为是这样的问题，用了更大的团簇，结果还是混淆在一起了，我查了一下有说是键之间不饱和引起 ...

要不然可以考虑做一下固定或是加氢饱和。感觉被截取的晶格面向外部的表面可能表面能很高，这种小团簇可能不太适合模拟固体的表面。

min · 发表于 Post on 2016-3-2 19:36:08

卡开发发发表于 2016-3-2 17:33
要不然可以考虑做一下固定或是加氢饱和。感觉被截取的晶格面向外部的表面可能表面能很高，这种小团簇可能 ...

那请问一下怎么做固定啊？先谢谢了

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