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[CP2K] cp2k计算偶极矩,并绘制光谱求助

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楼主
请问cp2k输出偶极矩文件后(RTTDDFT-output-moments.dat),怎么提取数据并画光谱图?谢谢

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发表于 Post on 2022-2-16 18:41:54 | 只看该作者 Only view this author
为什么不用线性响应TDDFT?用最新版Multiwfn基于CP2K的TDDFT输出文件直接就能绘制UV-Vis谱
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-16 19:15:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-16 18:41
为什么不用线性响应TDDFT?用最新版Multiwfn基于CP2K的TDDFT输出文件直接就能绘制UV-Vis谱

卢老师,您好。因为我看一些相关的文献,是用cp2k的RT-TDDFT计算的。所以我尝试用了REAL_TIME_PROPAGATION。但是后处理画图一直没搞对

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发表于 Post on 2022-3-25 19:42:16 | 只看该作者 Only view this author
@Bruce 发表于 2022-2-16 19:15
卢老师,您好。因为我看一些相关的文献,是用cp2k的RT-TDDFT计算的。所以我尝试用了REAL_TIME_PROPAGATIO ...

https://groups.google.com/g/cp2k/c/HWVSO5quEPQ/m/gE_M98ULAQAJ回复里有人提供的spectrum.py。自己用origin之类程序做傅里叶变换也可以实现

我感觉通过CP2K的real time propagation算电子激发问题相当难用,跑轨迹花的时间很长,结果还可能一团糟,手册写得也过于简单。只适合纯理论层面上的鼓捣,不适合作为应用层面的研究。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-28 11:31:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 @Bruce 于 2022-3-28 11:33 编辑

谢谢卢老师。我很赞同您说的手册该部分介绍简单。我发帖之前也看到了这个python脚本,画出来的图很奇怪,后面我改了nwchem的RT-TDDFT例子的脚本,画出来的图稍微好了点,但还是不很好。另外,感觉算的时候 $MD 部分没生效似的,我就觉得输入文件有问题,可对比了google组的一些例子还是没找到问题。

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发表于 Post on 2022-3-28 11:33:23 | 只看该作者 Only view this author
@Bruce 发表于 2022-3-28 11:31
谢谢卢老师。我很赞同手册该部分介绍简单。我发帖之前也看到了这个,画出来的图很奇怪,后面我改了nw ...

官网的H2CO例子居然连个结果都不给,就给个输入文件,实在不友好。而且那个例子的盒子偏小,跑到后来都出现密度截断了。用NWChem、Octopus跑这个大抵更好,虽然我没试过,但应该至少不至于比这更差。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-28 11:38:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-28 11:33
官网的H2CO例子居然连个结果都不给,就给个输入文件,实在不友好。而且那个例子的盒子偏小,跑到后来都出 ...

谢谢卢老师。试过Octopus,结果和别人已发表的类似分子的结果偏差甚大,其通过CP2K得到。NWchem没接触过

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