Shermo的一个小陷阱

gauss98 · 发表于 Post on 2022-2-18 10:56:53

刚才在试用shermo2.3.4
发现改变 sclZPE 校正因子的时候居然结果不变？感觉不可思议。多次验证检查，发现原来 sclZPE= 0.9850 //*** 设置参数的时候必须在 “=”与数值之间有一个空格，如果没有空格，就默认为 1.0了
但是我认为在文本编辑的时候极易忽略这一点格式差异，如果我不是试用时改变各种参数验证，直接用计算结果（很难发现差异），那数据就全部偏差了。

希望社长检验是否属实，如果属实，在数据输入格式上增加一点冗余度。

另外，设置 conc=1.0，在输出中仍然没有找到计算 1atm->1M 的自由能变的计算结果。

sobereva · 发表于 Post on 2022-2-18 11:09:19

原本的文件都有空格，没有理由自己改的时候把空格去了

gauss98 · 发表于 Post on 2022-2-18 11:25:56

sobereva 发表于 2022-2-18 11:09
原本的文件都有空格，没有理由自己改的时候把空格去了

谢社长解答

冰释之川 · 发表于 Post on 2022-2-18 11:34:59

gauss98 发表于 2022-2-18 11:25
谢社长解答

直接在命令行里传递参数不就完事了吗？
比如shell脚本里这么写：

Shermo $file -ilowfreq $ilowfreq_treatment -T $temperature -P $pressure -sclZPE $sclZPE > temp_out.txt 2>&1

复制代码

陌上芬菲 · 发表于 Post on 2022-2-18 11:46:10

感谢分享。
这种“bug”很烦人，出了错很难找出来。
看过一遍就大概知道，避免日后也入坑。

这种报告论坛应该鼓励。

snljty · 发表于 Post on 2022-2-18 12:00:03

不是很懂这个哪里算bug了，软件本身配置文件第一行写的这么清楚，用之前多少也应该看一下呀。

sobereva · 发表于 Post on 2022-2-18 19:33:28

刚才更新了一下Shermo 2.3.4，现在不需要必须有空格了

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2022-2-18 19:44:39

本帖最后由 liyuanhe211 于 2022-2-18 19:45 编辑

snljty 发表于 2022-2-18 12:00
不是很懂这个哪里算bug了，软件本身配置文件第一行写的这么清楚，用之前多少也应该看一下呀。

现在很多成品软件容错性太高，惯坏了。算个feature request还行

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[辅助/分析程序] Shermo的一个小陷阱

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