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[Gaussian/gview] 求助:Gaussian安装问题

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按照sob老师教程安装linux g16后,照计算“计算RESP原子电荷的超级懒人脚本(一行命令就算出结果)去计算RESP电荷,但gau.out提示


Entering Gaussian System, Link 0=g16
Files in the Gaussian directory are world accessible.
This must be fixed.

通过查阅了解是权限问题,但是安装时候按照步骤输入了
chmod 750 -R *

然后觉得也许是自己忘记了,重新输入chmod 750 -R *,结果还是不行,请问各位老师应该如何解决?


0B3FA995BCCE79B8D9E1541DE001AC56.jpg (29.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 83)

0B3FA995BCCE79B8D9E1541DE001AC56.jpg

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发表于 Post on 2022-2-23 13:44:57 | 只看该作者 Only view this author
按照Gaussian官方安装说明处理即可.
搞750操作, 某些时候会遇到麻烦.
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发表于 Post on 2022-2-23 18:14:27 | 只看该作者 Only view this author
你先用ls -l看看当前目录下的Gaussian的那些文件是否对应了750的权限,如果chmod设置没生效,可能你根本就没修改的权限,用root账户改
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-25 22:57:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-2-23 18:14
你先用ls -l看看当前目录下的Gaussian的那些文件是否对应了750的权限,如果chmod设置没生效,可能你根本就 ...

谢谢社长回复,原因找到了,因为我是双系统,安装g16的磁盘是ntfs,然后执行chmod时,即使是root也改不动,后来磁盘分区为ext4就可以了,但是现在我还有一个问题就是。我的电脑CPU是AMD 5950X,我装了G16-A03-AVX2,之前不了解,用的时候出现Error: illegal instruction, illegal opcode,看您2015年一个帖子回复,很可能是CPU架构与版本不兼容,请问,我应该用g16的哪个版本呢,或者只能换机子?

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发表于 Post on 2022-2-25 23:16:02 | 只看该作者 Only view this author
sun877469558 发表于 2022-2-25 22:57
谢谢社长回复,原因找到了,因为我是双系统,安装g16的磁盘是ntfs,然后执行chmod时,即使是root也改不动 ...

5950X可以用avx2,社长gaussian安装教程有说明,http://sobereva.com/439

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发表于 Post on 2022-2-25 23:37:08 | 只看该作者 Only view this author
sun877469558 发表于 2022-2-25 22:57
谢谢社长回复,原因找到了,因为我是双系统,安装g16的磁盘是ntfs,然后执行chmod时,即使是root也改不动 ...

export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge如果分区格式希望双系统都能读取,可以考虑exFAT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-26 13:11:03 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2022-2-25 23:37
export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge如果分区格式希望双系统都能读取,可以考虑exFAT

感谢指导,按照您说的命令,已经解决问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-2-26 13:11:59 | 只看该作者 Only view this author
casea 发表于 2022-2-25 23:16
5950X可以用avx2,社长gaussian安装教程有说明,http://sobereva.com/439

根据社长文章所述 http://sobereva.com/439
运行Gaussian前通过这行命令定义环境变量:export PGI_FASTMATH_CPU=sandybridge。
成功解决问题,谢谢

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发表于 Post on 2022-5-24 20:23:03 | 只看该作者 Only view this author
按照sob老师说的在虚拟机上安装gaussian09 但安装过程中出现问题 请问这个怎么解决

202205242021438331..png (17.5 KB, 下载次数 Times of downloads: 66)

202205242021438331..png

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发表于 Post on 2022-5-24 20:37:59 | 只看该作者 Only view this author
Roonry 发表于 2022-5-24 20:23
按照sob老师说的在虚拟机上安装gaussian09 但安装过程中出现问题 请问这个怎么解决

截图你的.bashrc。大概率是没设置g09root环境变量。

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发表于 Post on 2022-5-24 20:51:40 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-5-24 20:37
截图你的.bashrc。大概率是没设置g09root环境变量。

麻烦帮我看看有什么问题吗

无标题.png (47.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 82)

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发表于 Post on 2022-5-24 21:07:57 | 只看该作者 Only view this author
Roonry 发表于 2022-5-24 20:51
麻烦帮我看看有什么问题吗

不能叫g09D01,最底下一层目录必须叫g09。或者说你的Gaussian安装目录必须是$g09root/g09。

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发表于 Post on 2025-6-8 19:19:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qcn1211 于 2025-6-8 23:11 编辑

请问集群系统上out文件只有“Entering Gaussian System, Link 0=g16” 这一行字是出了什么问题?原来一直都正常

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