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[GROMACS] 求助:用gromacs进行接触角模拟在能量最小化的时候结构不合理

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各位老师,我用gromacs模拟一块金属板上的液滴,想进行接触角方面的模拟。初始结构如下,为在金属板上的有一个半圆形液滴。可是我进行能量最下化之后液滴全部散开了,这明显不合理。请问这是什么原因呢?

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初始结构.png

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能量最小化.png

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发表于 Post on 2022-3-8 21:50:16 | 只看该作者 Only view this author
这和金属与氧之间的范德华作用的参数密切相关
你可以把LJ势阱深度调大、调小,看如何影响跑出来的结果。当然,在讨论这部分参数之前应确保拓扑文件本身合理、mdp里的设置合理
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