计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3399|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 求助Fe3+配合物的优化中出现挤在一起的不合理构型

[复制链接 Copy URL]

89

帖子

0

威望

831

eV
积分
920

Level 4 (黑子)

求助各位老师,我在优化还有Fe3+d的配合物时,经常出现拥挤在一起的情况(很不合理),不知道是什么原因造成的,请各位老师指导一下。

(1)Fe3+结合6个H2O进行优化,使用关键词:
# opt freq b3lyp/genecp scrf=(PCM,solvent=water) SCF=xqc
其中加SCF=xqc关键词,是一直不收敛尝试了很多次后才加的,结果优化很多步后构型如下图所示(没算完,但是貌似构型很不合理了)。
输出文件已上传(Fe3+_6w.log

(2)Fe3+结合另外一个体系优化,使用关键词:
#p opt(gdiis,maxstep=5,notrust,recalc=3) freq b3lyp/genecp scrf=(solve nt=h2o,pcm)
结果还是出现了挤在一起的情况,输出文件已上传(M+Fe3+_2w.log)。
是不是构型搭建或者关键词使用有问题,因为在搭建的其他Fe3+配合物时也有类似的问题新出现。

请各位老师指导,谢谢大家!

Fe3 构型.jpg (22.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

中间构型

中间构型

log文件.rar

703.92 KB, 下载次数 Times of downloads: 14

4291

帖子

4

威望

9565

eV
积分
13936

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2022-3-14 20:18:20 | 只看该作者 Only view this author
输出文件里很多警告 Warning!  O  atom    2 has  8 valence electrons but only   0 basis functions.
如果你有经验的话,其实看到“拥挤在一起”就会反应出是输入文件里基组格式有误,有些原子没有指定基组。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

83

帖子

0

威望

2942

eV
积分
3025

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2022-3-15 08:42:14 | 只看该作者 Only view this author
原因应该是没有给O原子指定基组。把输入文件贴出来看一下。

89

帖子

0

威望

831

eV
积分
920

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-15 09:49:54 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-3-14 20:18
输出文件里很多警告 Warning!  O  atom    2 has  8 valence electrons but only   0 basis functions.
如 ...

谢谢老师的回复和提醒

218

帖子

2

威望

2037

eV
积分
2295

Level 5 (御坂)

5#
发表于 Post on 2022-3-18 11:11:13 | 只看该作者 Only view this author
这种体系的SCF收敛难度通常不是很高,所以遇到这种只能用二次收敛方法才能收敛的情况,可以先考虑一下是不是关键词写错了(除了未给原子指定基组之外,还有一个常见的就是自定义赝势基组时写了gen而不是genecp)

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-27 21:48 , Processed in 0.733766 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list