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[新手求助] 如何画 HOMO-LUMOgap 能量和分子量关系图

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求大神帮助,这个图中的HOMO-LUMO gap部分图是怎么画

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发表于 Post on 2022-3-23 16:35:35 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/543的方法读取每个分子的HOMO-LUMO gap
建立一个excel表,第一列是所有分子的分子量,第二列是对应的HOMO-LUMO gap,作柱状图
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-3-24 09:55:18 | 只看该作者 Only view this author
先用Gaussian算一批分子,得到fch文件(或用比如ORCA算一批分子,得到molden文件)。
下文说了,Multiwfn载入fch、molden等含有占据和空轨道信息的文件后进入主功能0时会在屏幕上直接显示HOMO-LUMO gap
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269http://bbs.keinsci.com/thread-462-1-1.html
显然可以用grep或awk提取出来

明白了一个分子怎么得到HOMO-LUMO gap的基础上,按照下文,自己写个脚本调用Multiwfn批量提取
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html

提取后你将得到一个文件,每一行是一个分子的HOMO-LUMO gap。之后放到比如Origin里,做个频数统计产生柱形图就完了。

你当前贴的图并没有体现分子量。Multiwfn载入文件后屏幕上会直接给出分子量,你也可以在脚本里提取出来。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-12 09:18:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-24 09:55
先用Gaussian算一批分子,得到fch文件(或用比如ORCA算一批分子,得到molden文件)。
下文说了,Multiwfn ...

谢谢

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