请问如何在gromacs中选择合适力场替代compass力场下对于超临界CO2和聚合物体系研究

高处裹棉被 · 发表于 Post on 2022-3-24 15:32:56

本帖最后由高处裹棉被于 2022-3-24 16:35 编辑

各位老师好，我想要采用gromacs模仿一篇采用MS软件在compass力场下，进行超临界CO2在聚合物体系中的溶解扩散行为研究的文献，请问该如何选择合适的力场。

在查阅诸多文献后，已发现采用OPLS-AA和GAFF力场可以对聚合物进行很好的描述，而TraPPE-small适用于描述超临界二氧化碳，请问两个力场能否混用，还是统一采取OPASS-AA或GAFF力场？

如果要混用力场的话请问怎么平均LJ势，我查到混用力场的文献中有写As for cross site-site interactions, we applied the geometric mean mixing rule for both LJ parameters，但具体该怎么操作？

谢谢各位老师

zaqxs234 · 发表于 Post on 2022-3-24 21:17:21

个人见解：如用混合立场可计算模拟后的密度、溶解度参数等与文献对比，相差不大即可

sobereva · 发表于 Post on 2022-3-25 08:36:44

不得不混用。本来GAFF等普通有机分子力场就严重描述不好超临界二氧化碳

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[GROMACS] 请问如何在gromacs中选择合适力场替代compass力场下对于超临界CO2和聚合物体系研究

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