计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3719|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VMD] 求助:改变离子颜色

[复制链接 Copy URL]

82

帖子

0

威望

489

eV
积分
571

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
改变原子的方法好像并不适合离子,不管是element的还是name,整个离子颜色就是没有变化。
我的离子是单个原子,然后利用forcite而来。

173

帖子

0

威望

1802

eV
积分
1975

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2022-3-26 23:28:01 | 只看该作者 Only view this author
在图层里面——Draw style里面ColorID可以试试
独立之精神 自由之思想

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2022-3-27 11:10:20 | 只看该作者 Only view this author
仔细看此文搞清楚逻辑
在VMD程序里对不同元素的原子用不同颜色显示的方法
http://sobereva.com/624http://bbs.keinsci.com/thread-26306-1-1.html

对普通原子,和单原子的离子,没有任何区别
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

82

帖子

0

威望

489

eV
积分
571

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-27 11:27:58 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mengxiangidea 于 2022-3-27 11:29 编辑
sobereva 发表于 2022-3-27 11:10
仔细看此文搞清楚逻辑
在VMD程序里对不同元素的原子用不同颜色显示的方法
http://sobereva.com/624(http ...

sob老师,我在categories的时候选择element中选择O将它变成红色,H用白色,在representation选中coloring method的时候,虽然离子开始变色了,但是我原来设置的水分子里面O和H又不变了。整个建模是从packmol过来的。

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2022-3-27 11:36:11 | 只看该作者 Only view this author
mengxiangidea 发表于 2022-3-27 11:27
sob老师,我在categories的时候选择element中选择O将它变成红色,H用白色,在representation选中coloring ...

搞清楚这几点
1 当前用的什么着色方式
2 当前用的着色方式怎么定义的颜色
3 到底输入文件里有没有元素信息

搞清楚以上三点自然就能明白怎么回事
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 22:38 , Processed in 0.181541 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list