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[Gaussian/gview] 求助,用高斯计算CO2水合过程,吉布斯自由能与文献出入较大的原因

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我根据文献(http://dx.doi.org/10.1016/j.jcat.2014.06.001)采用了BMK level, PCM溶剂化模型, 基组使用6-311++G(d,p),计算了CO2在水中的水解过程。结果表示,产物(H+和HCO3-)与反应物(H2O和CO2)的吉布斯自由能相差10kcal/mol左右。


但我采用了相同的计算方式,计算的结果相差巨大。以下是我的输入文件
1.     H+:
# opt freq BMK/6-311++g(d,p) scrf=(solvent=water)
Title Card Required
1 1
H                 -1.80319726    1.62625187    0.00000000
2.     HCO3-:
# opt freq BMK/6-311++g(d,p) scrf=(solvent=water)
Title Card Required
-1 1
C                  0.00000000    0.17465100    0.00000000
O                  1.23206500    0.41359100    0.00000000
O                 -1.00143200    0.90550700    0.00000000
O                 -0.30469600   -1.24772800    0.00000000
H                  0.59250000   -1.61886500    0.00000000
3.     H2O:
# opt freq BMK/6-311++g(d,p) scrf=(solvent=water)
Title Card Required
0 1
O                  0.00000000    0.00000000    0.11974300
H                  0.00000000    0.76157100  -0.47897200
H                  0.00000000   -0.76157100  -0.47897200
4.     CO2:
# opt freq BMK/6-311++g(d,p) scrf=(solvent=water)
Title Card Required
0 1
C                  0.00000000    0.00048900    0.00000000
O                  1.15944300   -0.15017500    0.00000000
O                 -1.15944300    0.14980900    0.00000000
计算出的吉布斯能分别为:
H+           -0.174563 Hartree
HCO3-       -264.528308 Hartree
H2O         -76.419852 Hartree
CO2         -188.572092 Hartree
其中,H+和HCO3-减去H2O和CO2的吉布斯自由能约为181kcal/mol,与文献的10kcal/mol相差巨大。

想请问下,这样是因为哪一步骤算错造成的。

202203282030247911..png (451.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 66)

202203282030247911..png

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发表于 Post on 2022-3-28 20:59:40 | 只看该作者 Only view this author
因为水溶液里H+是以H3O+的形式存在的,所以H+的自由能如果要算的话需要按H3O+的自由能减去H2O的自由能来算,另外也可以直接采用文献里现成的参考值。
仔细阅读http://sobereva.com/327
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-29 10:28:03 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-28 20:59
因为水溶液里H+是以H3O+的形式存在的,所以H+的自由能如果要算的话需要按H3O+的自由能减去H2O的自由能来算 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-29 10:50:04 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-3-28 20:59
因为水溶液里H+是以H3O+的形式存在的,所以H+的自由能如果要算的话需要按H3O+的自由能减去H2O的自由能来算 ...

老师您好,按您的方法计算后,
H3O+ 吉布斯自由能为 -76.796。减去水的吉布斯自由能后, H+的吉布斯自由能为-0.37641。
最后换算后求得的反应吉布斯自由能大约为-55kcal/mol, 虽然下降了但还是与文献差距较大,想请问还可能是什么原因造成的呀。

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发表于 Post on 2022-3-29 15:46:45 | 只看该作者 Only view this author
yzy1995123 发表于 2022-3-29 03:50
老师您好,按您的方法计算后,
H3O+ 吉布斯自由能为 -76.796。减去水的吉布斯自由能后, H+的吉布斯自由 ...

可以试试改用SMD溶剂模型,PCM对溶质和溶剂之间的氢键作用描述不好
Zikuan Wang
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天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

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发表于 Post on 2022-3-29 18:59:29 | 只看该作者 Only view this author
你不妨查一下CO2+H2O=H2CO3平衡常数和H2CO3的pKa值,算一下实验Gibbs自由能。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

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发表于 Post on 2022-3-29 22:55:10 | 只看该作者 Only view this author
最好是考虑4个水分子与H+形成的H9O4+

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