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楼主 Author: zha23
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[算法与编程] 求助,SCF并行化方案

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发表于 Post on 2022-4-2 00:32:20 | 只看该作者 Only view this author
zha23 发表于 2022-3-31 19:24
pyscf中有一个参数我不明白,其积分中有一个为cache缓存的参数,但我不知道其作用是什么,以及怎么用
(*in ...

你可以去issue区提问

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MOKIT开发者

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发表于 Post on 2022-4-2 00:54:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-4-2 01:07 编辑
zha23 发表于 2022-3-31 17:22
谢谢各位,我所在的课题组是做EDA的,老师觉得GAMESS的效率拖累了EDA的效率,所以想重新写一个自洽场。

GAMESS慢 倒还不是主要问题,你看PSI4也没快到哪里去,但是能免费做SAPT这个特点就是很香;GAMESS的SCF收敛性差,收敛关键词太少,收敛功能太弱、不支持检验波函数稳定性等等缺点限制了GKS-EDA的用途。这些我跟苏老师交流过。

论坛上有很多人做EDA过程中SCF不收敛,为了临时地解决这个问题,我去年在MOKIT里写了frag_guess_wfn小程序(https://gitlab.com/jxzou/mokit),此小程序可以自动调用Gaussian做HF/DFT计算,然后生成GKS-EDA输入文件(内含坐标、基组和片段及整体的轨道,及GKS-EDA关键词),这样在GAMESS里的GKS-EDA时间就基本可以忽略不计了,一般算3圈就很可能收敛了。

我倒是建议你直接基于PySCF或ORCA,看能否调用他们的接口,加上你自己GKS-EDA做分解部分的代码,得到GKS-EDA分解结果,这样不仅计算速度快,开发程序也快。如果你还能整合进pyscf主分支,或添加进ORCA开源脚本区https://github.com/ORCAQuantumChemistry/CompoundScripts,那就造福大量人了。当然,如果你的抱负是开发一整个量化程序,那从最基本的开始写是可以的。

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卡开发发 + 5 不是所有人都是带师23333
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自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-2 19:23:53 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-4-2 00:54
GAMESS慢 倒还不是主要问题,你看PSI4也没快到哪里去,但是能免费做SAPT这个特点就是很香;GAMESS的SCF收 ...

多谢您的建议,我这一部分代码是寒假为了复习之前知识写的,主要我对这方面有一定兴趣,以及除了EDA,XMVB计算的SCF效率也较低,老师也想自己做一套独立的,正好也可以当作明年研究生开题的课题。

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发表于 Post on 2022-4-2 23:40:17 | 只看该作者 Only view this author
zha23 发表于 2022-4-2 19:23
多谢您的建议,我这一部分代码是寒假为了复习之前知识写的,主要我对这方面有一定兴趣,以及除了EDA,XMV ...

那毕业估计比较危险了

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zjxitcc + 2 大实话233333

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发表于 Post on 2022-4-3 20:29:00 | 只看该作者 Only view this author
你的上一个帖子不是已经解决了效率问题吗,为什么在issue里面还说efficiency much lower than pyscf

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发表于 Post on 2022-4-3 21:54:47 | 只看该作者 Only view this author
zha23 发表于 2022-4-2 12:23
多谢您的建议,我这一部分代码是寒假为了复习之前知识写的,主要我对这方面有一定兴趣,以及除了EDA,XMV ...

那我倒觉得不如把XMVB的源码要来,然后在上面改,改善XMVB的效率,这样受益的不止你一个,还有所有XMVB的用户。相比之下,你自己写SCF代码哪怕确实比XMVB快了,也肯定很难有比XMVB更多的用户。
量化软件也是国外卡中国脖子的方向之一,如果每个有志向写量化程序的人都从SCF从头做起,那中国永远也做不出能匹敌国外的软件,等于有100个地基但是没有一座高楼。

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王二葛 + 3 我很赞同

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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