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[GROMACS] 求助:请问gromacs模拟如何实现负压?

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求助:请问gromacs模拟如何像文献上一样实现负压强?

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发表于 Post on 2022-4-15 19:05:11 | 只看该作者 Only view this author
恰当设置盒子尺寸就完了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-16 12:04:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-4-15 19:05
恰当设置盒子尺寸就完了

卢老师,请问我可以直接在mdp文件里压强参数那里直接设置一个负压强的数值吗?

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发表于 Post on 2022-4-16 14:24:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 牧生 于 2022-4-16 14:26 编辑
Lisy 发表于 2022-4-16 12:04
卢老师,请问我可以直接在mdp文件里压强参数那里直接设置一个负压强的数值吗?
压强有负值吗?
我的理解是,常压是0.1 MPa,绝对真空是0 MPa。如果设定为0~0.1之间,就可以认为是负压。

你给出的图,比如-100 MPa,这个负号,会不会指的是加压方向?
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发表于 Post on 2022-4-17 03:10:48 | 只看该作者 Only view this author
Lisy 发表于 2022-4-16 12:04
卢老师,请问我可以直接在mdp文件里压强参数那里直接设置一个负压强的数值吗?

你看原文是NPT还是NVT模拟的
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