gmx_mmpbsa报错：IndexError: list index out of range

benwei12138 · 发表于 Post on 2022-4-17 18:46:34

老师好，我用的gmx_mmpbsa做丙氨酸扫描过程中如下报错：

[INFO ] Mutating trajectories...
IndexError: list index out of range

——————————————————
我的短肽序列是G------Y，对于中间的残基突变都没有发生报错，但是对于第七位的Y做丙氨酸扫描就发生了以上报错
ParmEd用的是官方安装的版本
请问一下各位老师这种情况该怎么办，是程序的bug还是需要重头突变跑MD跑能量计算？下面附上输入文件

wch53 · 发表于 Post on 2024-7-13 22:05:24

请问解决了吗

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[GROMACS] gmx_mmpbsa报错：IndexError: list index out of range

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