求助：使用MMPBSA对复合物的残基进行结合自由能的分解

阿志 · 发表于 Post on 2022-4-28 15:01:32

我在一篇文献中看到amber可以计算结合自由能，也可以对结合自由能进行分解，而且是对关键氨基酸进行能量分解（类似于这个图片），我想问一下，这个应该如何实现？

Frozen-Penguin · 发表于 Post on 2022-4-28 17:47:03

好像是要在输入文件里设置idecomp和print_res，具体内容见amber手册，36.3. Running MMPBSA.py，&decomp namelist variables

阿志 · 发表于 Post on 2022-5-2 08:16:56

Frozen-Penguin 发表于 2022-4-28 17:47
好像是要在输入文件里设置idecomp和print_res，具体内容见amber手册，36.3. Running MMPBSA.py，&decomp na ...

好的，谢谢

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