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[Multiwfn使用咨询] 使用RESP懒人脚本计算时报错forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fau...

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前几天计算的时候还是正常的,后来装了个gmx-MMPBSA,今天天计算就报错,文件夹里也没有输出文件,请教一下各位老师是什么原因,非常感谢
用的是sob的Mul结合ORCA一键计算resp电荷的脚本,命令是./RESP_ORCA.sh xbj.mol2 +1自旋多重度默认1,溶剂默认水。
脚本调用Mul的命令应该是这个
### Calculate RESP charges
echo Running Multiwfn...
Multiwfn SP.molden -ispecial 1 > /dev/null << EOF
7
18
1
y
0
0
q
EOF

xbj.mol2

2.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

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发表于 Post on 2022-5-13 14:40:34 | 只看该作者 Only view this author
贴出脚本调用Multiwfn的完整命令,以及相关的输入文件
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-13 15:09:49 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-5-13 14:40
贴出脚本调用Multiwfn的完整命令,以及相关的输入文件

老师您好,命令和输入文件已上传,感谢您的指导
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发表于 Post on 2022-5-14 00:25:25 | 只看该作者 Only view this author
没有叫Mul的程序,我极度反感以任何形式简写Multiwfn

仔细看此文,搞清楚脚本运行机制
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html

如果当前目录下已经出现了给Multiwfn用的molden文件,按下文手动用Multiwfn算RESP电荷看具体出现什么情况(Multiwfn输出的信息全拷到文本文件里上传)
RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算
http://sobereva.com/441http://bbs.keinsci.com/thread-10880-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-14 10:07:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-14 00:25
没有叫Mul的程序,我极度反感以任何形式简写Multiwfn

仔细看此文,搞清楚脚本运行机制

抱歉sobereva老师,下次不会再犯了,非常感谢老师的指导
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