太多做实验的人对计算有误解了~~~

huahuasky · 发表于 Post on 2022-5-22 22:22:33

吐槽，我感觉太多做实验的人都以为计算很简单诶~~~

有个做实验的老师找我，超级没礼貌，一上来就说，帮我算个东西
我：“先跟我说说算什么，我看看能不能算”
他：描述计算问题
我看了一下，就是个几何优化算算能量，挺好算的，我就问：“那么我们以什么形式合作呢？”
他：“以前别人帮我算，我都是在致谢上感谢一下的~ 找外面的代算公司，花两万算的又快又好，blablabala.....”就是决口不提要给我加作者或者劳务费~~~
我：“老师，我们课题组的一贯做法，都是加共一或者共同通讯的，你考虑看看”
然后过了半天，他的学生找我，跟我说不算了~真是翻白眼一百遍~~~

还遇到个合作的老师，帮他找过渡态，花了有几天，确实找不到，他就问，难道这个不是扔给电脑，电脑就自己算出来了么~~~~

他们似乎都不知道，计算要机时，要花时间了解这个化学体系，要思考要花精力.........

希望这个世界对做理论计算的人多一点尊重吖~~~~~

chemren2 · 发表于 Post on 2022-5-23 09:40:49

那就别惯着他们

ABetaCarw · 发表于 Post on 2022-5-23 10:42:47

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rugals · 发表于 Post on 2022-5-23 23:08:05

我遇到的大多数情况是对计算的结果嗤之以鼻

尤其是对高分子聚合物相关的计算

ReviewReview · 发表于 Post on 2022-6-1 19:55:48

rugals 发表于 2022-5-23 23:08
我遇到的大多数情况是对计算的结果嗤之以鼻

尤其是对高分子聚合物相关的计算

所以Gaussian对高分子聚合物相关的计算受认可的是吧老师？我也看到我们领域的顶刊有用Gaussian来算塑料光老化的。我刚好就是用Gaussian中的DFT计算来解释PVDF超滤膜污染机理的，所以对这个问题很关心，看到您的这句话心里一颤，需要特意再问下您确认下比较安心

。。。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-1 20:10:02

ReviewReview 发表于 2022-6-1 12:55
所以Gaussian对高分子聚合物相关的计算受认可的是吧老师？我也看到我们领域的顶刊有用Gaussian来算塑料光 ...

必须保证所算的性质用寡聚物也能描述得足够好，而且必须做充分的构象搜索，必须考虑色散，必须考虑溶剂效应（即便聚合物是固相，也要用溶剂模型或者QM/MM描述周围的聚合物链，不能觉得不加溶剂就是在算固相了），该用显式溶剂的地方必须用显式溶剂。主要就是注意这些问题。
这个和用不用高斯关系不大，不受认可的往往不是计算软件，而是计算方法，很多人觉得泛函基组选对了就万事大吉了，其实根本不是这样的

ReviewReview · 发表于 Post on 2022-6-1 22:50:14

wzkchem5 发表于 2022-6-1 20:10
必须保证所算的性质用寡聚物也能描述得足够好，而且必须做充分的构象搜索，必须考虑色散，必须考虑溶剂效 ...

昂昂谢谢老师，这下明白啦~

hdmd · 发表于 Post on 2022-6-4 12:50:18

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sobereva · 发表于 Post on 2022-6-5 10:22:11

hdmd 发表于 2022-6-4 12:50
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一方面可能是编辑的短见，一方面也可能之前投过去的计算灌水文章太多，干脆一刀切了

huahuasky · 发表于 Post on 2022-6-9 12:15:14

你们和做实验的合作发文章，都给几作？？？？我发现除了很大的做计算的组，能争取个一作或者共通，其他基本都是二作及以下~~感觉没意义~~劳动不值得咧

EdwardLimit · 发表于 Post on 2022-6-10 13:22:30

huahuasky 发表于 2022-6-9 12:15
你们和做实验的合作发文章，都给几作？？？？我发现除了很大的做计算的组，能争取个一作或者共通，其他基本 ...

我们组的计算，我一个人做，了解他们的体系，就要看不下20篇文章，小型测试，各种摸条件要花几天一个星期，一个工作基本上要做一两个月，最后整完给个二作。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-10 15:44:51

EdwardLimit 发表于 2022-6-10 06:22
我们组的计算，我一个人做，了解他们的体系，就要看不下20篇文章，小型测试，各种摸条件要花几天一个星期 ...

一两个月的工作给二作已经很良心了。。。算一年给三作的例子也不少
最让人难受的一种情况是，实验只要求你瞎算一通，让文章里有点计算撑门面，根本不要求你计算得到什么新insight，但是你不愿意瞎算一通，因为计算圈子里的人如果看到你瞎算的文章，心里反倒会给你扣分，等于从你的角度讲，发这篇文章比不发还差。所以你还是认认真真地用高精度方法算，付出了很多心血，但是实验那边不需要你的这些额外的心血，所以也不会体谅你，只会怪罪你算得太慢，“别人拿B3LYP做这么多计算两周就算完了，你怎么三个月还没动静”。而你的这些努力的结果也只是让这篇文章对你的影响由负值变成一个很小的正值而已，相当于是花时间买了个累赘。

rugals · 发表于 Post on 2022-6-10 18:04:48

ReviewReview 发表于 2022-6-1 19:55
所以Gaussian对高分子聚合物相关的计算受认可的是吧老师？我也看到我们领域的顶刊有用Gaussian来算塑料光 ...

辅助的定性说明可以，定量计算很少有人信

rugals · 发表于 Post on 2022-6-10 18:05:27

wzkchem5 发表于 2022-6-1 20:10
必须保证所算的性质用寡聚物也能描述得足够好，而且必须做充分的构象搜索，必须考虑色散，必须考虑溶剂效 ...

学到了，感谢

EdwardLimit · 发表于 Post on 2022-6-10 19:46:44

wzkchem5 发表于 2022-6-10 15:44
一两个月的工作给二作已经很良心了。。。算一年给三作的例子也不少
最让人难受的一种情况是，实验只要求 ...

我主要做经典MD，MC。电子时空层面的计算确实花时间，但我觉得计算结果要是和实验结果要是对的上，基本上能说明理论猜测是能解释实验现象的，和不计算主观猜机理完全不是一个级别的，只可惜搞实验的不管这些，反而觉得搞计算就是动动手指，至于您说的圈子里的人怎么看你的工作，我早就已经悟了，只挑那些一眼就知道好做的工作，其他的能拒就拒，要不然真的是给自己挖坑跳。

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[吐槽] 太多做实验的人对计算有误解了~~~

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