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[Gaussian/gview] 麻烦帮我看看MgMOF单点能优化的问题

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发表于 Post on 2022-5-27 09:54:23 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
Sob社长和高斯大佬们好,

我建了个MgMOF的模型,(共500个原子,3258个电子),周围暴露的O原子也都加氢饱和了,然后用高斯跑了下单点能优化。我最终的目的是想做MOF的静电势(ESP)分布,所以想通过单点能先来计算下能量。

参数如下:
%nprocshared=60
%mem=16GB
%chk=MgMOF.chk
# b3lyp/6-31g

Mg-MOF

0 1

输出结果显示SCF不收敛,l502报错,如下所示。

>>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
SCF Done:  E(RB3LYP) =  -30539.9700487     A.U. after  129 cycles
            NFock=128  Conv=0.81D-03     -V/T= 2.0037
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /home-gg/Soft/Gaussian.D01.Linda/g09/linda-exe/l502.exel at Fri May 27 09:06:02 2022.
Job cpu time:       4 days  9 hours 26 minutes 35.1 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   9041 Int=      0 D2E=      0 Chk=    270 Scr=      1
failed to open execfile


我不敢再去随意调参数了,想麻烦sob社长和各路大佬们帮我再指点一下,谢谢(高斯输入文件已附)

(顺便问下社长,有没有不通过计算单点能或结构优化也可以分析MOF静电势分布的呢?)

MgMOF.gjf

32.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 18

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发表于 Post on 2022-5-27 16:14:43 | 显示全部楼层 Show all
像423号碳这样的碳没有用氢饱和。把所有这类碳都用氢饱和,再算。
所有共价断键都要饱和,不止是氧,碳也不能忽略。

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发表于 Post on 2022-5-28 03:20:02 | 显示全部楼层 Show all
6-31G根本没法用,就算不给碳带极化,最起码也得给氧带上。不然不仅结构不合理,静电势还极烂。

如果嫌结构优化太耗时,用xtb在GFN2-xTB级别下优化,然后Gaussian用B3LYP/6-31G*算个单点得到波函数文件并用Multiwfn计算静电势。你当前明显不是算不动这个体系的单点。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-28 15:24:38 | 显示全部楼层 Show all
wzkchem5 发表于 2022-5-27 16:14
像423号碳这样的碳没有用氢饱和。把所有这类碳都用氢饱和,再算。
所有共价断键都要饱和,不止是氧,碳也 ...

嗯嗯好的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-28 15:27:59 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-5-28 03:20
6-31G根本没法用,就算不给碳带极化,最起码也得给氧带上。不然不仅结构不合理,静电势还极烂。

如果嫌 ...

好的社长,xtb我还不会用,我先按照您提示的基组再计算个单点能看看。谢谢社长

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-28 16:01:31 | 显示全部楼层 Show all
sysu_chem 发表于 2022-5-28 15:27
好的社长,xtb我还不会用,我先按照您提示的基组再计算个单点能看看。谢谢社长

社长好,我用了b3lpy泛函,对以下原子分别指定了基组,您看看合理不。我已提交到超算上了,先跑跑看

C H O 0
6-31G(d)
****
Mg 0
6-31G
****

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发表于 Post on 2022-5-28 18:09:21 | 显示全部楼层 Show all
sysu_chem 发表于 2022-5-28 09:01
社长好,我用了b3lpy泛函,对以下原子分别指定了基组,您看看合理不。我已提交到超算上了,先跑跑看

C ...

Mg也必须加极化函数

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-28 19:56:30 | 显示全部楼层 Show all
wzkchem5 发表于 2022-5-28 18:09
Mg也必须加极化函数

好的老师,我把Mg也加上,再跑个任务看看

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-30 10:18:44 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-5-28 03:20
6-31G根本没法用,就算不给碳带极化,最起码也得给氧带上。不然不仅结构不合理,静电势还极烂。

如果嫌 ...

社长早上好,前几天按照您的指点,我将体系都赋予了极化函数,如下:
%nprocshared=60
%mem=16GB
%chk=MgMOF0530.chk
# b3lyp/6-31G(d)
但今天计算结束还是502报错。

我看了您的帖子《关于SCF不收敛的解决办法》,对输入文件加了SCF=noincfock语句,如下:
%nprocshared=60
%mem=16GB
%chk=MgMOF0530.chk
# b3lyp/6-31G(d)  SCF=noincfock
已重新提交服务器再跑一下看看。

社长帮我看看上面语句是否合理,我好再做调整,谢谢社长。

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发表于 Post on 2022-5-30 10:24:36 | 显示全部楼层 Show all
sysu_chem 发表于 2022-5-30 10:18
社长早上好,前几天按照您的指点,我将体系都赋予了极化函数,如下:
%nprocshared=60
%mem=16GB

关键词本身没问题,但光加这个解决问题的概率很有限
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发表于 Post on 2022-5-30 10:40:37 | 显示全部楼层 Show all
其实我第一次知道单点SCF还能不收敛。。,因为我之前都是优化好的结构算单点,我以为单点这种任务不会失败。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-30 10:44:49 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-5-30 10:24
关键词本身没问题,但光加这个解决问题的概率很有限

社长,您的意思还需要加哪些关键词吗?我用的b3lyp泛函

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-30 10:45:48 | 显示全部楼层 Show all
七尺贱 发表于 2022-5-30 10:40
其实我第一次知道单点SCF还能不收敛。。,因为我之前都是优化好的结构算单点,我以为单点这种任务不会失败 ...

我是想用单点来分析静电势,所以就暂没有进行结构优化

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发表于 Post on 2022-5-31 06:41:45 | 显示全部楼层 Show all
sysu_chem 发表于 2022-5-30 10:44
社长,您的意思还需要加哪些关键词吗?我用的b3lyp泛函

尝试博文里的各种方法,顶端红字说了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-31 09:17:55 | 显示全部楼层 Show all
sobereva 发表于 2022-5-31 06:41
尝试博文里的各种方法,顶端红字说了

好,谢谢社长。顺便想再问下社长,能不能通过用MS的forcite模块进行动力学结构优化,然后再用于分析静电势呢

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