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[VASP] NEB计算结果远低于文献报道值的可能原因?

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本帖最后由 Daisy_zju 于 2022-6-7 14:55 编辑

求助各位老师,最近我在使用VASP计算CINEB复现一篇文献中Li在Li2Se表面的迁移能垒(https://doi.org/10.1021/acs.nanolett.1c02658),选取了和文献一样的参数计算之后发现吸附能为 -0.21 eV,
与文献报道的 -0.46 eV 不符,随之计算的扩散能垒(0.06 eV)也远低于文献的报道值(0.63 eV),联系文章通讯作者未果,想请各位老师帮忙查看可能是哪里出了问题,下面是我的计算详情,附件是扩散轨迹图,如果有其他需要的计算文件我后续补上来。

1、下图是我的计算案例的扩散路径 :triple hollow Li——bridge——triple hollow Se


2、我的INCAR文件内容
IVDW = 11
Global Parameters
ISTART =  0            (Read existing wavefunction; if there)
NWRITE = 1
ICHARG =  1            (Non-self-consistent: GGA/LDA band structures)
LREAL  = Auto           (Projection operators: automatic)
# LDIPOL = .TRUE.
# IDIPOL = 3 # add dipole correction
ENCUT  =  400          (Cut-off energy for plane wave basis set, in eV)
PREC   =  Accurate     (Precision level)  
LWAVE = .TRUE. # whether the wavefunctions are written to the WAVECAR file
LCHARG = .TRUE. # LCHARG determines whether the charge densities (files CHGCAR and CHG) are written.
LVTOT = .FALSE. # whether the total local potential is written to the LOCPOT file
LVHAR = .FALSE. # whether the electrostatic potential is written to the LOCPOT file
LELF = .FALSE. # whether to create an ELFCAR file or not.
LCHARG = .FALSE.       (Write CHGCAR or not)
ADDGRID= .TRUE.        (Increase grid; helps GGA convergence)
LREAL = Auto
# LVTOT  = .TRUE.      (Write total electrostatic potential into LOCPOT or not)
# LVHAR  = .TRUE.      (Write ionic + Hartree electrostatic potential into LOCPOT or not)
# NELECT =             (No. of electrons: charged cells; be careful)
# LPLANE = .TRUE.      (Real space distribution; supercells)
# NPAR   = 4           (Max is no. nodes; don't set for hybrids)
NCORE  = 4

Electronic Relaxation
  ISMEAR =  1            (Gaussian smearing; metals:1)
  SIGMA  =  0.05         (Smearing value in eV; metals:0.2)
  NELM   =  60           (Max electronic SCF steps)  
  NELMIN =  4            (Min electronic SCF steps)
  EDIFF  =  1E-07        (SCF energy convergence; in eV)
  GGA  =  PE             (PBEsol exchange-correlation)

Ionic Relaxation
  NELMIN =  6            (Min electronic SCF steps)
  NSW    =  300           (Max electronic SCF steps)
  IBRION =  3            (Algorithm: 0-MD; 1-Quasi-New; 2-CG)
  ISIF   =  2            (Stress/relaxation: 2-Ions, 3-Shape/Ions/V, 4-Shape/Ions)
  EDIFFG = -0.02        (Ionic convergence; eV/AA)
  POTIM = 0            (POTIM sets the time step (MD) or step width scaling (ionic relaxations)
  ISYM =  0            (Symmetry: 0=none; 2=GGA; 3=hybrids)
  ICHAIN = 0
  LCLIMB = .TRUE.
  SPRING = -5
  IMAGES = 4
  IOPT = 1
(这里我觉得ENCUT取400也有点不大合理,但是暂时还是和文献保持了一致)

3、KPOINTS选取gamma-points, 5   5   1,赝势文件分别为PAW_PBE Li_svPAW_PBE Se

4、文献的computational details,我的POSCAR和文献描述一致。








5、下图是计算结果图,能垒为0.06 eV

原子最大受力的变化很正常,收敛标准设置为-0.03 eV/AA

过渡态(03)的切向力也很正常,在03处由负转正且接近0

验证过渡态只有一个虚频




实在是联系不上通讯作者,个人觉得0.06 eV的能垒的确不合理,但是各方面自查都找不到原因,还请各位老师能帮忙一起看看!感激不尽!

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发表于 Post on 2022-6-1 14:37:57 | 只看该作者 Only view this author
vtst有问题吧

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-1 21:21:55 | 只看该作者 Only view this author

好的,我试试重新编译一下vtst,谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-1 21:22:37 | 只看该作者 Only view this author

不知道第二个问题,初始距离大于5A的情况前辈遇到过或者了解过吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-7 14:58:07 | 只看该作者 Only view this author

前辈,我重新按您的建议编译了之后可以正常计算了,但是又出现了一些问题,上面的问题已经更新了,可以麻烦您再帮我看看吗?

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发表于 Post on 2022-6-10 14:35:31 | 只看该作者 Only view this author
不太了解你的体系ISMEAR=1是否合适? 看下几个结构OSZICAR里的mag值是否相同?是否收敛到不同的电子态上?
初末态过渡态结构 取ISMEAR=0,算下单点能对比看看?
PS 我也是zju的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-10 15:42:07 | 只看该作者 Only view this author
yuexiatx 发表于 2022-6-10 14:35
不太了解你的体系ISMEAR=1是否合适? 看下几个结构OSZICAR里的mag值是否相同?是否收敛到不同的电子态上?
...

的确是ISMEAR不合适,我更改之后熵的值比较合理了,但是能垒还是和文献报道区别很大,感觉NEB的随机性过强了

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