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[GROMACS] 已解决| 安装好window下编译的gromacs后,在终端输入gmx无响应的问题

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本帖最后由 frank666 于 2022-6-19 11:22 编辑

各位论坛大神好,最近我换了新电脑,就跟着sobereva大神的教程(http://bbs.keinsci.com/thread-11848-1-1.html)去安装编译好的windows下的gromacs,因为之前我安装过一次,能正常使用,所以我确定安装过程是没有问题。但这次安装后我在终端输入gmx后,终端什么反应都没有,平时如果出错的话一般也有个error提示一下,但这次什么都没有提示,捣鼓了一整天也弄不出来,因此想请教一下各位大神,这是什么原因呢,有没有解决办法呢。

202206031112167506..png (30.45 KB, 下载次数 Times of downloads: 30)

202206031112167506..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-3 11:49:13 | 只看该作者 Only view this author
补充一下,我好像没有说的特别清楚,我安装的是教程里的——笔者预编译的原生Windows版的gromacs2020.6

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发表于 Post on 2022-6-3 12:04:21 | 只看该作者 Only view this author
输入where gmx回车显示结果是什么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-3 12:59:40 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-6-3 12:04
输入where gmx回车显示结果是什么?

您好,这是输入了where gmx 后的反馈结果

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发表于 Post on 2022-6-3 13:44:36 | 只看该作者 Only view this author
frank666 发表于 2022-6-3 11:49
补充一下,我好像没有说的特别清楚,我安装的是教程里的——笔者预编译的原生Windows版的gromacs2020.6

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

运行gmx mdrun -h看看显示什么
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-3 15:13:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-3 13:44
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员 ...

您好,输入了之后还是无任何提示。抱歉,我发帖的时候遗漏了这一项,下次必定注意

屏幕截图(3)(1).png (25.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

屏幕截图(3)(1).png

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发表于 Post on 2022-6-3 16:50:19 | 只看该作者 Only view this author
估计和电脑硬件有关,比如CPU型号

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-3 17:18:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 frank666 于 2022-6-3 17:22 编辑
lyj714 发表于 2022-6-3 16:50
估计和电脑硬件有关,比如CPU型号

您好,我换了其他人的电脑试了一下,结果他的电脑秒装上了,他的CPU是英特尔 Xeon E5-2620,我的是E5620,请问gromacs对CPU的要求是什么呢,可以直接查得到吗,如果是和硬件相关是不是除了换硬件就无解呢,切换操作系统为linux可以解决吗,不好意思,我是小白,所以问题比较多,先谢谢您的回答与指导

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发表于 Post on 2022-6-3 17:31:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lyj714 于 2022-6-3 17:36 编辑
frank666 发表于 2022-6-3 17:18
您好,我换了其他人的电脑试了一下,结果他的电脑秒装上了,他的CPU是英特尔 Xeon E5-2620,我的是E5620 ...

你这cpu属古董级别了,都不支持AVX指令集,所以sob用avx指令集编译的二进制程序你当然用不了。除非你自己编译window或者linux版本都可以用,只不过都需要你直接自己源码编译才行。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-3 19:27:20 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 frank666 于 2022-6-3 19:28 编辑
lyj714 发表于 2022-6-3 17:31
你这cpu属古董级别了,都不支持AVX指令集,所以sob用avx指令集编译的二进制程序你当然用不了。除非你自己 ...

原来如此,谢谢,请问大佬,跑动力学的话有没有推荐的CPU呢,我是3070的显卡,高显低U会很限制机子性能吗

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发表于 Post on 2022-6-4 05:53:33 | 只看该作者 Only view this author
frank666 发表于 2022-6-3 19:27
原来如此,谢谢,请问大佬,跑动力学的话有没有推荐的CPU呢,我是3070的显卡,高显低U会很限制机子性能吗

主流8核CPU搭配这个足矣
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-4 10:02:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-4 05:53
主流8核CPU搭配这个足矣

谢谢sob大神的推荐,万分感激

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