molclus+Gaussian做构型优化，单分子结构出现小变化如何解决？

忘不掉的回忆 · 发表于 Post on 2022-6-12 17:30:11

本帖最后由忘不掉的回忆于 2022-6-12 17:31 编辑

老师好，请问一下我在做molclus+Gaussian做构型优化时，单分子结构出现了小变化（下图圆圈所示），请问这正常吗？如何解决这个问题。谢谢老师
下图两个分子是DMC和DMF

我用的是b3lyp/6-31g（d,p） em=gd3bj 对分子构型进行的优化
单分子结构优化用的也是b3lyp/6-31g（d,p） em=gd3bj
我研究的共沸体系要考虑氢键；

chands · 发表于 Post on 2022-6-12 17:50:34

你的构型变了吗，我感觉只是甲基转了一个角度

忘不掉的回忆 · 发表于 Post on 2022-6-12 18:16:36

chands 发表于 2022-6-12 17:50
你的构型变了吗，我感觉只是甲基转了一个角度

对，就是甲基稍微转了一点

chands · 发表于 Post on 2022-6-12 18:31:25

忘不掉的回忆发表于 2022-6-12 18:16
对，就是甲基稍微转了一点

正常，单键转一点不需要太高能量。两个分子相互作用足以使单键旋转

忘不掉的回忆 · 发表于 Post on 2022-6-12 18:35:48

chands 发表于 2022-6-12 18:31
正常，单键转一点不需要太高能量。两个分子相互作用足以使单键旋转

谢谢老师，谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-12 22:54:11

外环境和分子对称性不符的时候自然会导致分子对称性下降，只是程度问题

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[新手求助] molclus+Gaussian做构型优化，单分子结构出现小变化如何解决？

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