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[新手求助] 如何计算S1到Sn, T1到Tn的激发态吸收谱

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当我们采用分子的基态结构直接运行TD-DFT计算,我们能得到S0到Sn的基态吸收谱(GSA)。

在瞬态吸收光谱实验中,在分子激发到S1后,经过一段时间的延迟,产生第二个脉冲探测得到S1到Sn的激发态吸收谱(ESA)。如果在一段时间后,S1通过内转换等形式衰减到T1,也可以得到T1到Tn的ESA。

我目前的工作就是要计算一个基态是闭壳层单重态的分子系统的S1到Sn和T1到Tn的ESA,然后跟实验上得到的ESA进行对比。

我目前想到的计算ESA的方法:

1.        T1到Tn的ESA:
1)        UDFT优化三重态基态T1,电子自旋设为3.
2)        取出T1的结构,作为参考,然后进行TDDFT计算,得到T1到Tn的ESA。
2.        S1到Sn的ESA:
1)        用单重态基态结构,运行TD-DFT计算,并优化S1.
2)        取出S1的结构坐标,运行TD-DFT,得到S1到Sn的ESA。

不知道以上方法可行不?

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发表于 Post on 2016-4-12 20:53:55 | 只看该作者 Only view this author
原理上可行
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-12 21:15:08 | 只看该作者 Only view this author

谢谢Sob老师的回复,请问还有其他可行的方法吗?

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发表于 Post on 2016-4-12 21:19:10 | 只看该作者 Only view this author
wuyulele 发表于 2016-4-12 21:15
谢谢Sob老师的回复,请问还有其他可行的方法吗?


其它具体指什么?不用TDDFT或是过程不同?
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发表于 Post on 2019-1-14 10:32:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-12 21:19
其它具体指什么?不用TDDFT或是过程不同?

请教老师:能计算如图的瞬态吸收光谱吗?

TA.jpg (44.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 135)

TA.jpg

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发表于 Post on 2019-1-14 12:23:06 | 只看该作者 Only view this author
熊琳 发表于 2019-1-14 10:32
请教老师:能计算如图的瞬态吸收光谱吗?

可以。激发态之间的能量差通过TDDFT计算就可以得到,激发态之间的振子强度结合Multiwfn也可以得到
利用Multiwfn计算Gaussian输出的激发态之间的跃迁偶极矩
http://sobereva.com/227
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发表于 Post on 2019-1-14 15:53:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-14 12:23
可以。激发态之间的能量差通过TDDFT计算就可以得到,激发态之间的振子强度结合Multiwfn也可以得到
利用M ...

谢谢老师。

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发表于 Post on 2019-4-3 08:22:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 huangyoyo 于 2019-4-3 08:34 编辑

用 UDFT,电子自旋设为3,做分子动力学能得到一定温度压强下的T1结构么?在这个结构下做TDDFT得到的振子强度有什么物理意义?
如何得到一定温度压强下的S1结构?

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发表于 Post on 2019-4-3 10:26:08 | 只看该作者 Only view this author
huangyoyo 发表于 2019-4-3 08:22
用 UDFT,电子自旋设为3,做分子动力学能得到一定温度压强下的T1结构么?在这个结构下做TDDFT得到的振子 ...

得不到。非凝聚相情况下原子间平均距离很大,根本不足以显著影响几何结构,不明显影响势能面自然也就不影响T1结构
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发表于 Post on 2021-5-24 09:46:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-14 12:23
可以。激发态之间的能量差通过TDDFT计算就可以得到,激发态之间的振子强度结合Multiwfn也可以得到
利用M ...

请问Sob老师,按照MultiWFN手册3.21.5步骤得到了transdipmom.txt之后,能否直接用MultiWFN绘出光谱呢?需要怎么操作?

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发表于 Post on 2021-5-24 19:43:03 | 只看该作者 Only view this author
bxu764 发表于 2021-5-24 09:46
请问Sob老师,按照MultiWFN手册3.21.5步骤得到了transdipmom.txt之后,能否直接用MultiWFN绘出光谱呢?需 ...

看Multiwfn手册3.13.2节里plain text file格式的介绍,手动把激发能、振子强度数据写成这种格式,就能用Multiwfn载入并绘图(按绘制UV-Vis光谱的步骤)
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发表于 Post on 2023-5-29 15:13:12 | 只看该作者 Only view this author

老师,那这样就是,
如果我算T1到Tn的跃迁,就写
# td=(triplet,root=1,nstates=20)

0 3

T1优化坐标

——————

如果我算S1到Sn,就写
# td=nstates=20

0 1

S1优化坐标

——————
这样对吗?我想确认一下root是不是都等于1,然后T1到Tn的要写triplet。
麻烦老师了。

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发表于 Post on 2023-5-29 16:01:03 | 只看该作者 Only view this author
jpp651460301 发表于 2023-5-29 08:13
老师,那这样就是,
如果我算T1到Tn的跃迁,就写
# td=(triplet,root=1,nstates=20)

只算当前结构下的垂直激发的话,不用写root,但写了也不算错。
triplet关键字指的是当基态是单重态时算三重态激发态,当基态不是单重态时这个关键词不起作用,写不写都是计算和基态自旋多重度相同、和比基态自旋多重度大2的激发态,没有办法只计算其中一种自旋多重度而不计算另外一种。
另外如果你只需要T1到Tn的激发能,不需要跃迁偶极矩的话,有时更可靠的做法是以S0为参考态,把T1和Tn都当作激发态来算。至于什么时候需要以T1为参考态、什么时候以S0为参考态,参见http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 6&fromuid=21811
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-6-1 14:03:37 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-5-29 16:01
只算当前结构下的垂直激发的话,不用写root,但写了也不算错。
triplet关键字指的是当基态是单重态时算 ...

好的,谢谢你的回复。我再看看那个帖子学习一下。

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发表于 Post on 2023-11-27 21:00:11 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zhouxi 于 2023-11-27 23:02 编辑

请教楼主和各位老师,楼主提到“在瞬态吸收光谱实验中,在分子激发到S1后,经过一段时间的延迟,产生第二个脉冲探测得到S1到Sn的激发态吸收谱(ESA)”这第二脉冲探测到的为什么可以肯定为S1到Sn的激发呀?像图中的733 nm处的尖峰,怎么判断他属于哪个激发态的跃迁吸收呀?并且在复合助催化剂之后,这个峰的减弱,是说明该激发态激发跃迁之后的电子减少了?还是该激发态的跃迁电子减少了呀?

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