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[GROMACS] gmx4.5.6与gmx2018计算速度差别

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纯水体系4800原子,1ns模拟,其他条件一致,单节点24核测试的结果:gmx4.5.6是477.5ns/day,gmx2018是124.6ns/day

我想询问一下,是否有做过类似对比的,4.5.6的计算速度有比2018快那么多吗,还是我的样本体系太小了?

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发表于 Post on 2022-6-13 15:02:54 | 只看该作者 Only view this author
对比明显有问题
公正情况下gmx2018速度至少绝不比4.5.6慢
注意并行方式、模拟设置、编译条件等方面的可比性
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发表于 Post on 2022-6-14 00:09:30 | 只看该作者 Only view this author
好多文章还是用4.5,不知道他们图个啥?

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