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[新手求助] 如何确定[1][2]原子连线的中点与[3][4]原子连线的中点之间的距离?

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如上图所示,请问各位老师如何确定[1][2]原子连线的中点与[3][4]原子连线的中点之间的距离呢?

感谢老师的回复!!!

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天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

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发表于 Post on 2022-6-21 13:57:47 | 只看该作者 Only view this author
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

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发表于 Post on 2022-6-21 14:17:03 | 只看该作者 Only view this author
写个最简单最简单的脚本就能算出来...
用GaussView的话,用Select Atoms by Clicking工具选上左边两个原子,然后点那个碳原子的图标(Element Fregment)选点上面的X然后选X Atom,再点Builder -> Place Fragment at Centroid of Selected Atoms,在左边两个原子的中点添加一个虚原子X。对右边的两个原子同样操作,在右边两个原子中间添加一个虚原子X。然后用Modify Bond工具测量两个虚原子X之间的距离就行。

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4#
发表于 Post on 2022-6-21 15:07:28 | 只看该作者 Only view this author
如果不会写脚本的话,在excel里写公式也可以,或者甚至手算也可以。只要用记事本打开gjf、out或log文件,找到这4个原子的坐标,剩下就是立体几何问题了,放到高考里都是送分题的难度。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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