计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 3333|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 求助无垒反应判断和速率常数计算

[复制链接 Copy URL]

39

帖子

0

威望

897

eV
积分
936

Level 4 (黑子)

1)各位老师好, 我目前在算的反应体系中发生质子转移反应,已经找到了过渡态,下图是根据过渡态跑的irc数据,对两端进行优化以及计算单点后,发现过渡态相比反应物,自由能垒大概为-1.59kcal/mol
该反应是否可以认为是无垒反应?那这种过程可否把计算得到的负的自由能能垒带入到sob老师的速率常数计算表格中使用?(http://sobereva.com/soft/TSTcalculator.xlsx

2)另外还有一个反应的过渡态,计算得到的自由能垒为负值(-1.82kcal/mol),但是利用电子能量计算得到的能垒为正值(2.12 kcal/mol),那请问这个反应是否属于无垒反应?

谢谢各位老师解答

1万

帖子

0

威望

9868

eV
积分
22108

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2022-6-22 16:03:25 | 只看该作者 Only view this author
(1)不能,按我刚才在这里http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 6&fromuid=21811提到的方法计算
(2)必须按自由能垒判断
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

39

帖子

0

威望

897

eV
积分
936

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-22 18:01:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-22 16:03
(1)不能,按我刚才在这里http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=redirect&goto=findpost&ptid=30539&pid= ...

谢谢老师回复。大概看了下,应该就是用VTST的方法计算
看了论坛里其他资料我认为计算步骤就是:选择IRC过渡态前后几个点在之前算单点能的水平上进行振动分析,然后可以利用Kisthelp软件进行CVT方式的VTST计算。
不知道理解的对不对

1万

帖子

0

威望

9868

eV
积分
22108

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2022-6-22 21:16:51 | 只看该作者 Only view this author
牛文文 发表于 2022-6-22 11:01
谢谢老师回复。大概看了下,应该就是用VTST的方法计算
看了论坛里其他资料我认为计算步骤就是:选择IRC ...

对。你说的跟我说的不是一类计算方法,不过你说的这种也是可以的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

87

帖子

0

威望

1162

eV
积分
1249

Level 4 (黑子)

5#
发表于 Post on 2022-6-23 09:28:33 | 只看该作者 Only view this author
牛文文 发表于 2022-6-22 18:01
谢谢老师回复。大概看了下,应该就是用VTST的方法计算
看了论坛里其他资料我认为计算步骤就是:选择IRC ...

个人认为应该对那在那几个点做振动分析时采用:`freq=projected`关键词,以在投影掉反应路径的前提上做Hessian对角化

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 03:15 , Processed in 0.250438 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list