求助：freq计算出错，SCF一圈就结束了

慢慢来比较快 · 发表于 Post on 2022-6-27 22:28:58

麻烦各位老师给看看，这个结构我是先进行的opt和freq进行计算，但是不知道为什么一到freq计算就错误停止，进行了单独的freq的计算以及调整、重新画结构重算也尝试了出现的错误相同。并且尝试换了机组也不大行。请求各路大神给予帮助，不胜感激。我将上传一个inp文件和out文件。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-27 22:49:23

确定高斯进程停止运行了吗，还是只是输出文件不再输出东西了？
如果是后者，不排除只是算得慢

慢慢来比较快 · 发表于 Post on 2022-6-27 23:11:08

wzkchem5 发表于 2022-6-27 22:49
确定高斯进程停止运行了吗，还是只是输出文件不再输出东西了？
如果是后者，不排除只是算得慢

老师，我用的是Linux搭载的G16，PBS命令，然后每次算到freq之后，运行状态就会变成U，然后过两三分钟就停止了，用link查看是一个失败的任务。

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-27 23:14:28

%mem给大再试
加上#P便于监控

如果不管多小的体系都有这问题，说明安装本身就有问题

chands · 发表于 Post on 2022-6-27 23:17:58

本帖最后由 chands 于 2022-6-27 23:21 编辑

慢慢来比较快发表于 2022-6-27 23:11
老师，我用的是Linux搭载的G16，PBS命令，然后每次算到freq之后，运行状态就会变成U，然后过两三分钟就停 ...

你的系统报错会有一个报错文件（我的是slurm)，你的out文件看不出问题。

慢慢来比较快 · 发表于 Post on 2022-6-27 23:32:51

保存文件前面的信息我也不太会分析，貌似是因为内存不够导致任务终止？

chands · 发表于 Post on 2022-6-28 08:19:07

慢慢来比较快发表于 2022-6-27 23:32
保存文件前面的信息我也不太会分析，貌似是因为内存不够导致任务终止？

最后一句：Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler.
正如楼上所说，内存不够。

Permission denied、Operation not permitted
应该是某个目录的权限不够，试一下用cd转到Gaussian所在目录，然后扩权，chmod 755 -R *

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