第11届北京科音分子动力学与GROMACS培训班将于8月13~16日于北京举办,是系统性学习分子动力学与GROMACS使用的最佳机会,请点击此链接查看培训详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 147|回复 Reply: 2

[GROMACS] 关于细胞膜模拟,给水分子在z轴上加上限制势的问题

[复制链接 Copy URL]

43

帖子

0

威望

195

eV
积分
238

Level 3 能力者

发表于 Post on 2022-7-4 20:26:39 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
老师您好,我通过您的http://sobereva.com/245帖子建立了一个细胞膜,其中您在帖子中提到了“如果在磷脂两端加水之后做MD的过程中发现有水钻进了磷脂膜的疏水部分,可以给水在Z方向加上限制势,跑几百ps之后磷脂分子就恰当地弛豫了,磷脂之间也没有什么缝隙了”。
我想请教您怎么给水分子在z轴上加上限制势?非常感谢

3万

帖子

99

威望

4万

eV
积分
84403

管理员

公社社长+计算化学玩家

发表于 Post on 2022-7-5 09:13:43 | 显示全部楼层 Show all
参考:

Clipboard01.png
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办最高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班基础(中级)量子化学培训班分子动力学与GROMACS培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班。这些培训是计算化学快速入门以及全面系统性提升研究水平的最佳途径,培训各种相关信息见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息、避免错过网上最有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气最高、水准最高的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人,讨论范畴相同
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(最强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

43

帖子

0

威望

195

eV
积分
238

Level 3 能力者

 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-5 09:53:21 | 显示全部楼层 Show all

嗯嗯,多谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )

GMT+8, 2022-8-12 01:25 , Processed in 0.494037 second(s), 27 queries .

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list