关于细胞膜模拟，给水分子在z轴上加上限制势的问题

wwl · 发表于 Post on 2022-7-4 20:26:39

老师您好，我通过您的http://sobereva.com/245帖子建立了一个细胞膜，其中您在帖子中提到了“如果在磷脂两端加水之后做MD的过程中发现有水钻进了磷脂膜的疏水部分，可以给水在Z方向加上限制势，跑几百ps之后磷脂分子就恰当地弛豫了，磷脂之间也没有什么缝隙了”。
我想请教您怎么给水分子在z轴上加上限制势？非常感谢

sobereva · 发表于 Post on 2022-7-5 09:13:43

参考：

wwl · 发表于 Post on 2022-7-5 09:53:21

sobereva 发表于 2022-7-5 09:13
参考：

嗯嗯，多谢老师

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[GROMACS] 关于细胞膜模拟，给水分子在z轴上加上限制势的问题

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