N2/O2的TraPPE模型参数如何加到itp文件中

喵星大佬 · 发表于 Post on 2024-12-5 15:18:11

raku 发表于 2024-12-5 10:44
请教下大佬，在O2_TraPPE和N2_TraPPE中都存在virtual site 名字为MW。发现在您的air.top中 [ atomtypes ] ...

都是没有vdW作用的虚拟点，只有电荷不同，只需要定义一次，电荷在moleculetype里定义就行

raku · 发表于 Post on 2024-12-5 16:34:50

喵星大佬发表于 2024-12-5 15:18
都是没有vdW作用的虚拟点，只有电荷不同，只需要定义一次，电荷在moleculetype里定义就行

明白了，谢谢！

还有个问题是在您的pdb中Mw为小写，itp中MW为大写，我试算时候说不对，我修改了就好了

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[GROMACS] N2/O2的TraPPE模型参数如何加到itp文件中