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[GROMACS] gromacs中log文件中这些DD后面的输出的含义是什么

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请教一下各位关于gromacs中log文件中这些DD后面的输出的含义是什么那?

DD  load balancing is limited by minimum cell size in dimension X
DD  step 130899999  vol min/aver 0.498! load imb.: force  6.0%  pme mesh/force 1.147
           Step           Time
      130900000   130900.00000

   Energies (kJ/mol)
        G96Bond       G96Angle    Proper Dih.          LJ-14     Coulomb-14
    2.27515e+02    1.06428e+03    1.11446e+02    2.95895e+02   -2.40924e+03
        LJ (SR)   Coulomb (SR)   Coul. recip.      Potential    Kinetic En.
    1.46205e+04   -1.05564e+05    5.11819e+02   -9.11419e+04    1.69742e+04
   Total Energy  Conserved En.    Temperature Pressure (bar)   Constr. rmsd
   -7.41678e+04   -1.11779e+05    2.49560e+02    1.28953e+03    1.81853e-07

DD  step 130999999  vol min/aver 0.629  load imb.: force  4.2%  pme mesh/force 1.169
           Step           Time
      131000000   131000.00000

   Energies (kJ/mol)
        G96Bond       G96Angle    Proper Dih.          LJ-14     Coulomb-14
    2.65538e+02    1.15043e+03    1.03704e+02    2.77734e+02   -2.38905e+03
        LJ (SR)   Coulomb (SR)   Coul. recip.      Potential    Kinetic En.
    1.37728e+04   -1.04192e+05    5.48326e+02   -9.04628e+04    1.68364e+04
   Total Energy  Conserved En.    Temperature Pressure (bar)   Constr. rmsd
   -7.36264e+04   -1.11945e+05    2.47534e+02    4.70294e+02    1.69685e-07


DD  load balancing is limited by minimum cell size in dimension X
DD  step 130899999  vol min/aver 0.498! load imb.: force  6.0%  pme mesh/force 1.147

DD  step 130999999  vol min/aver 0.629  load imb.: force  4.2%  pme mesh/force 1.169有什么区别吗?
下面Energies项是代表的各项的平均值吗?

感谢各位


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发表于 Post on 2022-7-6 02:20:09 | 只看该作者 Only view this author
DD = domain decomposition






哪来的什么平均值,平均什么
输出信息没有任何歧义

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云非侠 + 2 谢谢

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