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楼主 Author: ionexchangeC
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[算法与编程] 一个用DLPNO-CCSD(T)优化18碳环的结构的思路

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发表于 Post on 2022-8-10 23:09:43 | 只看该作者 Only view this author
ionexchangeC 发表于 2022-8-10 22:39
用DLPNO-CCSD(T)-M06-2X/cc-pVTZ(M06-2X为参考态的DLPNO-CCSD(T))按照这个方法优化,最后的结果是长碳碳 ...

为啥不用基于自旋极化UHF的DLPNO-UCCSD(T)。。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2022-8-11 07:09:55 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-8-10 23:09
为啥不用基于自旋极化UHF的DLPNO-UCCSD(T)。。

DLPNO-UCCSD(T)比DLPNO-CCSD(T)昂贵甚巨
而且UHF错误地高估了这个体系的对称破缺特征,用U还不如用R
另外U和R我实际用CCSD优化的结果基本没差别
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-15 11:48:37 | 只看该作者 Only view this author
又用CASSCF和NEVPT2优化了18碳环,取的活性空间是(8,8)。
CASSCF:长键1.356埃,短键1.199埃
NEVPT2:长键等于短键,1.289埃
CASSCF.txt (2.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 4) FIC-NEVPT2.txt (2.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

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发表于 Post on 2022-10-25 11:44:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2022-10-25 15:34 编辑

是否可以用CCSD(T)-F12(RI)/cc-pVDZ-F12试一下优化(看情况启用DLPNO;这个级别的精度相当于不带F12时的TZ基组结果)?

另外想请教一下,现在有程序支持“DFT的基态上做CC方法”的解析梯度吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-4 23:15:38 | 只看该作者 Only view this author
wjc404 发表于 2022-10-25 11:44
是否可以用CCSD(T)-F12(RI)/cc-pVDZ-F12试一下优化(看情况启用DLPNO;这个级别的精度相当于不带F12时的TZ基 ...

按理来说,你这个计算级别就算加了DLPNO也比普通地用DLPNO-CCSD(T)/cc-pVTZ贵吧

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发表于 Post on 2022-11-7 23:47:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2022-11-8 04:10 编辑
ionexchangeC 发表于 2022-8-15 11:48
又用CASSCF和NEVPT2优化了18碳环,取的活性空间是(8,8)。
CASSCF:长键1.356埃,短键1.199埃
NEVPT2: ...

看了一下(R1=1.22 Å,R2=1.34 Å时) RHF/def2TZVP的轨道hessian的(共3个)本征值小于零对应的向量中大于0.1的元素,发现牵涉最多的轨道为最高的8个占有轨道(均为π)和最低的8个未占有π轨道。它们在每个向量中都有较高贡献,且互相之间没有绝对的主次。猜测在轨道优化时仅考虑(8,8)的活性空间可能偏小了。但再往大就比较昂贵了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-8 11:38:55 | 只看该作者 Only view this author
cyclo[18]carbon.molden.input (7.48 MB, 下载次数 Times of downloads: 3)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-8 11:39:20 | 只看该作者 Only view this author
wjc404 发表于 2022-11-7 23:47
看了一下(R1=1.22 Å,R2=1.34 Å时) RHF/def2TZVP的轨道hessian的(共3个)本征值小于零对应 ...

已上传CASSCF波函数,欢迎讨论

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发表于 Post on 2022-12-5 10:16:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2022-12-5 10:24 编辑
ionexchangeC 发表于 2022-11-8 11:39
已上传CASSCF波函数,欢迎讨论
谢谢。我用ORCA跑cas(8,8)出来的波函数和这个差不多,能够收敛,但是后续的MCRPA计算发现casscf波函数不稳定(以及nevpt2计算中警告Koopmans矩阵存在负的本征值(结果未上传))。
计算结果: https://pan.baidu.com/s/1mL_uUeRGpgR_oknlpXv9rg 提取码: ari5

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发表于 Post on 2022-12-19 11:01:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Kalinite 于 2022-12-19 11:04 编辑
Mikasa 发表于 2022-7-15 09:43
可能只是手册没更新,我们已经用上了~

您好,请问应该通过什么方式实现呢,我在输入里直接调ALASKA,输出文件中显示仍然是numerical gradient。
  1. Numerical gradient, root     1
  2.   ---------------------------------------------
  3.                  X           Y           Z
  4.   ---------------------------------------------
  5.   O1          -0.046735   -0.066128   -0.000000
  6.   H1           0.086732   -0.011718   -0.000000
  7.   H2          -0.039997    0.077846    0.000000
  8.   ---------------------------------------------
  9. --- Stop Module: numerical_gradient at Mon Dec 19 10:04:31 2022 /rc=_RC_ALL_IS_WELL_ ---
  10. *** files: xmldump
  11.     saved to directory /export/home/chli/xjw/test/molcas/caspt2grad
  12. --- Module numerical_gradient spent 17 seconds ---
复制代码


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-12 19:35:08 | 只看该作者 Only view this author
2023.12.12更新:
用RHF为参考态,DLPNO-CCSD(T)/cc-pVTZ级别优化18碳环,结果是长键1.359埃,短键1.232埃

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发表于 Post on 2023-12-14 23:20:33 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
ionexchangeC 发表于 2023-12-12 19:35
2023.12.12更新:
用RHF为参考态,DLPNO-CCSD(T)/cc-pVTZ级别优化18碳环,结果是长键1.359埃,短键1.232埃

这是算了多长时间了? 不过结果可以用来引用的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-14 23:23:46 | 只看该作者 Only view this author
chrinide 发表于 2023-12-14 23:20
这是算了多长时间了? 不过结果可以用来引用的

我是为了测试超算做的这个任务,而我现在甚至忘记了测试账号的密码

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发表于 Post on 2024-2-10 00:14:52 | 只看该作者 Only view this author

你觉得慢可以自己来写,ccsd(T)的解析梯度很早以前就推出来了,

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