提问，关于T-REMD的执行脚本（已解决）

bdx · 发表于 Post on 2022-7-20 10:45:26

本帖最后由 bdx 于 2022-7-21 10:16 编辑

根据网上找到的教程，脚本是这么写的

然后我运行的时候提示mpirun:command not found, 我就把mpi的部分删了改成下面这样

然后执行时出现如下错误

想请问一下这个问题是什么原因导致的，是脚本的问题吗还是gromacs版本的问题（教程是2018，我用的是2022）

chenbq18 · 发表于 Post on 2022-7-20 17:12:09

先把脚本里的mdrun命令在命令行运行测试一下，是否正常

对抗路达摩 · 发表于 Post on 2022-7-20 23:47:36

似乎是2018或者某个版本之后就不能用 -multi来运行REMD了要用-multidir 你输入gmx mdrun -h 看一下
而且最好是使用mpi编译的gmx版本也就是和他命令相同的不然我不确定是直接不可以做REMD 还是不可以用显卡做REMD

bdx · 发表于 Post on 2022-7-21 09:23:42

对抗路达摩发表于 2022-7-20 23:47
似乎是2018或者某个版本之后就不能用 -multi来运行REMD了要用-multidir 你输入gmx mdrun -h 看一下
而且 ...

谢谢，确实是的，提示必须要MPI

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