计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 14031|回复 Reply: 12
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] gv中如何构建两个平行的分子?

[复制链接 Copy URL]

286

帖子

0

威望

1136

eV
积分
1422

Level 4 (黑子)

如图所示,要构建两个平行的碳纳米管,即图中红色框中的两个碳纳米管之间的6个C-C键的键长是相等的,该怎么调呢?调了一个C-C键,另外的C-C键又变了,感觉要是中间能加一个面,让他们对称就好了。。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120134

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2016-4-23 02:26:06 | 只看该作者 Only view this author
图中不是就一个碳纳米管么?让两个碳纳米管平行,和调整纳米管里面的C-C键有何关系?
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

286

帖子

0

威望

1136

eV
积分
1422

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-23 02:35:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-23 02:26
图中不是就一个碳纳米管么?让两个碳纳米管平行,和调整纳米管里面的C-C键有何关系?

图中是两个碳纳米管,主要是想让两个碳纳米管之间的C-C键距离都相等,图中两个碳纳米管之间一共有6个C-CJ键,我想先让两个碳纳米管平行,这样我调整6个C-C键中的一个C-C键距离,其它的5个也会和这个保持一致了。。

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17098

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2016-4-23 03:00:10 | 只看该作者 Only view this author
如果两个碳纳米管是一样的,制作一个,全选后将画笔选为剪切板,空白处点一下,第二个和原始的就是平行的。按住alt+shift拖动时可在不影响平行性的条件下移动。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +1 收起 理由
Reason
sobereva + 1 我很赞同

查看全部评分 View all ratings

286

帖子

0

威望

1136

eV
积分
1422

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-23 05:58:03 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-4-23 03:00
如果两个碳纳米管是一样的,制作一个,全选后将画笔选为剪切板,空白处点一下,第二个和原始的就是平行的。 ...

请问怎么将画笔选为剪切板呢?是点这里吗?可一点就变成这样了,因为上面那里是CH4。
         

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120134

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2016-4-23 07:59:27 | 只看该作者 Only view this author
lei234 发表于 2016-4-23 05:58
请问怎么将画笔选为剪切板呢?是点这里吗?可一点就变成这样了,因为上面那里是CH4。

你先把单个碳纳米管显示出来,然后界面左边的builder里点右下角那个按钮选中整个体系,然后ctrl+C把结构复制到剪切板里,然后按ctrl+shift+V再粘贴到当前窗口,此时就有两个管了,适当平移一个即可。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

1295

帖子

0

威望

6280

eV
积分
7575

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2016-4-23 08:54:59 | 只看该作者 Only view this author
我说一下我的一个笨办法,可能不实用哈。
1:我把分子坐标复制一份,然后把Z坐标取出来,然后放到orgin中,让他都加同一个数值,
2:把新的Z替换原来的Z,这样不就能实现两个分子Z方向有间距,X和Y不变了?
我的笨办法,不一定对哈
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

strive for greatness

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17098

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2016-4-23 08:55:14 | 只看该作者 Only view this author
lei234 发表于 2016-4-23 05:58
请问怎么将画笔选为剪切板呢?是点这里吗?可一点就变成这样了,因为上面那里是CH4。

你的最后一个图中“carbon tetrahedral”左边的那个按钮

286

帖子

0

威望

1136

eV
积分
1422

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-23 09:29:49 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2016-4-23 08:55
你的最后一个图中“carbon tetrahedral”左边的那个按钮

已解决,感谢两位大侠的相助,小女子感激不尽~~@sobereva

286

帖子

0

威望

1136

eV
积分
1422

Level 4 (黑子)

10#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-23 09:30:23 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2016-4-23 08:54
我说一下我的一个笨办法,可能不实用哈。
1:我把分子坐标复制一份,然后把Z坐标取出来,然后放到orgin中 ...

应该可以的~

720

帖子

0

威望

1252

eV
积分
1972

Level 5 (御坂)

11#
发表于 Post on 2016-4-23 19:35:16 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
用MS构建后再用gaussian算不行吗

286

帖子

0

威望

1136

eV
积分
1422

Level 4 (黑子)

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-4-25 02:15:09 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2016-4-23 19:35
用MS构建后再用gaussian算不行吗

应该可以的~~另外,你的头像很有创意~

720

帖子

0

威望

1252

eV
积分
1972

Level 5 (御坂)

13#
发表于 Post on 2016-4-25 19:47:48 | 只看该作者 Only view this author
lei234 发表于 2016-4-25 02:15
应该可以的~~另外,你的头像很有创意~

谢谢
自己画的

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 10:40 , Processed in 1.614290 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list