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[辅助/分析程序] 求助:关于使用Newton-X软件进行MD-TDDFT-OD检测时出错的求助

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按照手册进行安装,跑input-testnx.pl对所以高斯模块进行测试其中MD-G09-TDDFT-NAD-OD和MD-G09-TDA-NAD-CIO模块直接报错,MD-G09-TDDFT-NAD-CIO模块是和标准结果有些不同但是也OK。进入到DEBUG文件夹下打开error文件报错分别为:MD-G09-TDDFT-NAD-OD:

Cannot open gaussian.log! at /share/home/jjiang/NX-2.2-B09/bin/lib/colib_perl.pm line 365, <MEM> line 1.
/share/home/jjiang/NX-2.2-B09/bin/cioverlap-64/cioverlap.od: error while loading shared libraries: libblas.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
run_cioverlap: is dying now (cioverlap)
run-g09.pl: Error in run_cioverlap_g09.pl


MD-G09-TDA-NAD-CIO:
Error: segmentation violation
   rax 0000000000000000, rbx ffffffffffffffff, rcx ffffffffffffffff
   rdx 000000000002e3c6, rsp 00007ffe539b6c08, rbp 00007ffe539b71e0
   rsi 000000000000000b, rdi 000000000002e3c6, r8  00002ad31bbf5780
   r9  0000000000000000, r10 00007ffe539b5fe0, r11 0000000000000202
   r12 0000000000000000, r13 0000000000000000, r14 00007ffe539b7228
   r15 0000000000000000
  --- traceback not available
run-g09.pl: is dying now, Check Gaussian output: gaussian.log


想知道是安装问题吗?

我的.bashrc文件写的内容是:
# .bashrc
# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc
fi

# .bashrc
# Source global definitions
if [ -f /etc/bashrc ]; then
        . /etc/bashrc
fi

export g16root=$HOME/gaussian16
export GAUSS_SCRDIR=/tmp
. $g16root/g16/bsd/g16.profile

export NX=/share/home/jjiang/NX-2.2-B09/bin
export PATH=/share/home/jjiang/NX-2.2-B09/bin:$PATH
export PATH=/share/home/jjiang/caculation/molpro/molpro/bin:$PATH
export PATH=/share/softwares/g09:$PATH
export g09root=/share/softwares
export GAUSS_SCRDIR=/tmp
. $g09root/g09/bsd/g09.profile





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发表于 Post on 2022-8-19 23:19:25 | 只看该作者 Only view this author
你问的具体问题我不清楚,但提示说了没找到libblas.so.3,先把这个解决了。装BLAS库,如果已经装了,把libblas.so.3所在目录加入LD_LIBRARY_PATH环境变量。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-20 19:47:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-8-19 23:19
你问的具体问题我不清楚,但提示说了没找到libblas.so.3,先把这个解决了。装BLAS库,如果已经装了,把libb ...

谢谢社长的回复,LD_LIBRARY_PATH加了但是任然是同样的错误。顺带问一下,g09可以做TDA吗?我查了g09的手册没有关于TDA的描述,用09跑也是报l1的错,相反我用g16就可以跑TDA,输出是正常的。

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发表于 Post on 2022-8-20 21:17:04 | 只看该作者 Only view this author
zyy1997 发表于 2022-8-20 19:47
谢谢社长的回复,LD_LIBRARY_PATH加了但是任然是同样的错误。顺带问一下,g09可以做TDA吗?我查了g09的手 ...

至少G09 E.01能做TDA,手册里也写了
http://sobereva.com/g09/k_td.htm
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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