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楼主 Author: ZHANGZY
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[综合交流] sobMECP能计算S0和S1交叉点吗?

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发表于 Post on 2016-12-5 20:00:09 | 只看该作者 Only view this author
不妨试试用gamess的tddft寻找S0和S1的圆锥交叉点,

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发表于 Post on 2016-12-5 21:07:02 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2016-12-5 17:52
能,就是在集群上。我之前用过,可以的。教程我的都有啊。你不能用,是因为你没把文件全部放进去,少文件 ...

你是按照sob教程提交的吗?那个是单机提交的,没有节点间并行啊。
生活=做有意义的事

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发表于 Post on 2021-5-9 10:25:05 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-30 17:56
原理上可以,只要修改一下代码中收敛标准的判断即可。原先用于系间窜越MECP搜索,收敛条件之一是必须能量差 ...

请问Sob老师,用sobMECP计算相同多重度的态之间的交叉时,您提到需要修改代码中的收敛标准。那么,改了这个收敛标准后,这个程序就可以用在S0S1计算交叉了吗,有没有限制条件?(在您的帖子中曾看到,“(PS:这里说的都是搜索自旋多重度不同的态之间的MECP。搜索自旋多重度相同的态之间的MECP或避免交叉极小点只能用CASSCF,但如果能量分裂较大用TDDFT等单参考态方法也凑合,这些与本文无关就不多说了。)”(引自http://sobereva.com/286))

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发表于 Post on 2021-5-9 12:33:21 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2021-5-9 10:25
请问Sob老师,用sobMECP计算相同多重度的态之间的交叉时,您提到需要修改代码中的收敛标准。那么,改了这 ...


是否适用取决于理论方法能否合理描述交叉点附近的势能面
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2021-5-9 16:35:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Theor_Comp 于 2021-5-9 16:41 编辑
sobereva 发表于 2021-5-9 12:33

是否适用取决于理论方法能否合理描述交叉点附近的势能面

多谢sob老师。另外,用sobMECP可以得到交叉点的分子构型,如何方便的得到势能曲线呢?如下图D:\图片1.png

图片1.png (26.97 KB, 下载次数 Times of downloads: 44)

图片1.png

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发表于 Post on 2021-5-10 00:04:36 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2021-5-9 09:35
多谢sob老师。另外,用sobMECP可以得到交叉点的分子构型,如何方便的得到势能曲线呢?如下图

柔性扫描
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-5-10 07:00:42 | 只看该作者 Only view this author

如果是柔性扫描的话,在能量最低点构型,和MECP构型之间,如何选定要扫描的参数呢?二面角还是单键转动?分子结构特征并不明显

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发表于 Post on 2021-5-10 17:00:12 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2021-5-10 00:00
如果是柔性扫描的话,在能量最低点构型,和MECP构型之间,如何选定要扫描的参数呢?二面角还是单键转动? ...

这个取决于具体的体系,不能一概而论。没看到具体体系长什么样,肯定没办法回答
Zikuan Wang
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发表于 Post on 2021-5-10 18:59:57 | 只看该作者 Only view this author
Theor_Comp 发表于 2021-5-9 16:35
多谢sob老师。另外,用sobMECP可以得到交叉点的分子构型,如何方便的得到势能曲线呢?如下图

可能只是个定性的图吧

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发表于 Post on 2021-7-12 15:39:59 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2016-12-5 17:52
能,就是在集群上。我之前用过,可以的。教程我的都有啊。你不能用,是因为你没把文件全部放进去,少文件 ...

你好,可以发一份集群提交sobmecp的具体教程嘛,研究了好久还没有搞明白。非常感谢

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发表于 Post on 2021-7-12 15:44:33 | 只看该作者 Only view this author
单单 发表于 2021-7-12 15:39
你好,可以发一份集群提交sobmecp的具体教程嘛,研究了好久还没有搞明白。非常感谢

《使用sobMECP程序结合Gaussian程序搜索极小能量交叉点》http://sobereva.com/286

这还不够具体么
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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发表于 Post on 2021-7-12 15:52:23 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-7-12 15:44
《使用sobMECP程序结合Gaussian程序搜索极小能量交叉点》http://sobereva.com/286

这还不够具体么{:lo ...

这个我看到了,但是不会运行./prepare.sh,./runfirst.sh这些。应该怎么运行呢?

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发表于 Post on 2021-7-12 15:52:32 | 只看该作者 Only view this author
单单 发表于 2021-7-12 08:39
你好,可以发一份集群提交sobmecp的具体教程嘛,研究了好久还没有搞明白。非常感谢

这个没法做得太具体,因为不同集群的排队系统不一样。只能是说一下如何在单机上跑,你再结合你所用的集群的排队系统的说明书,把它翻译成如何在集群上提交。
这就好比高斯官网不会告诉你如何在集群上提交高斯,因为他们不知道你的集群是什么样的,只有你们集群的管理员或者你们组的其他人会告诉你。
Zikuan Wang
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2021-7-12 15:54:36 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-7-12 15:52
这个没法做得太具体,因为不同集群的排队系统不一样。只能是说一下如何在单机上跑,你再结合你所用的集群 ...

嗯嗯好吧,谢谢啦

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发表于 Post on 2021-7-12 15:56:36 | 只看该作者 Only view this author
单单 发表于 2021-7-12 08:52
这个我看到了,但是不会运行./prepare.sh,./runfirst.sh这些。应该怎么运行呢?

建议找本linux入门教材,看看关于bash的章节
Zikuan Wang
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