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[Molcas] openmolcas编译后试运行发生错误

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楼主
你好老师,这边我刚在网上自学了openmolcas编译,安装完成之后在运行000.input测试文件时出现以下问题。while calling mkdir: No such file or directory
0 parnell_base: cannot make directory /home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch/000
0 parnell: ABORTING
parnell failed to create a WorkDir at /home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch/000

我写的环境变量如下:
# openmolcas
export MOLCAS_WORKDIR=/home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch
export MOLCAS_MEM=4Gb
export MOLCAS=/home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/
export PATH=$MOLCAS/bin:$PATH
export MOLCAS_PRINT=3
export MOLCAS_NPROCS=1
export OMP_NUM_THREADS=4


请问老师这个问题应该如何解决?



202208252230367838..png (52.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

202208252230367838..png

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发表于 Post on 2022-8-25 22:41:47 | 只看该作者 Only view this author
(1)/home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch是真实存在的目录么?
(2)展示你提交OpenMolcas任务的具体命令
自动做多参考态计算的程序MOKIT

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-26 00:32:26 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-8-25 22:41
(1)/home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch是真实存在的目录么?
(2)展示你提交OpenMolcas任 ...

(1)/home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch存在。
(2)我使用的是ubuntu系统,提交任务的命令如下:
   pymolcas 000.input 000.out &

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发表于 Post on 2022-8-26 00:59:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-8-26 01:03 编辑
cxh19990601 发表于 2022-8-26 00:32
(1)/home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch存在。
(2)我使用的是ubuntu系统,提交任务的命 ...

先清空 临时文件目录,然后运行pymolcas 000.input >& 000.out,观看000.out文件内容,如果有报错,把000.out文件上传到论坛。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-26 11:56:40 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2022-8-26 00:59
先清空 临时文件目录,然后运行pymolcas 000.input >& 000.out,观看000.out文件内容,如果有报错,把000 ...

老师您好,还是发生报错,结果和1L相同

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发表于 Post on 2022-8-26 12:30:19 | 只看该作者 Only view this author
cxh19990601 发表于 2022-8-26 11:56
老师您好,还是发生报错,结果和1L相同

(1)运行ls /home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch,截图展示结果;(2)上传000.out文件,不要说“和1L相同”。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-26 21:16:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cxh19990601 于 2022-8-26 21:18 编辑
zjxitcc 发表于 2022-8-26 12:30
(1)运行ls /home/chan/downloads/OpenMolcas-v22.06/scratch,截图展示结果;(2)上传000.out文件,不 ...

老师,我在将整体文件(scratch在内)移动到home目录下解决了临时文件问题,目前又出现了新的问题,我使用pymolcas 005.input >& 005.out & 执行005号test的试计算,发生错误,out文件在附件,请问老师,这个问题应该如何解决?现在的环境变量更改为:
export MOLCAS_MEM=4Gb
export MOLCAS=/home/chan/OpenMolcas-v22.06/build
export PATH=$MOLCAS/bin:$PATH
export MOLCAS_PRINT=3

005.out

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发表于 Post on 2022-8-26 21:32:49 | 只看该作者 Only view this author
cxh19990601 发表于 2022-8-26 21:16
老师,我在将整体文件(scratch在内)移动到home目录下解决了临时文件问题,目前又出现了新的问题,我使 ...

各种路径和环境变量有点乱,看输出文件显示怎么有的东西跑到/usr/share/openmolcas里去了,pymolcas跑到/usr/bin/pymolcas里了。建议删掉现在的openmolcas目录,删掉/usr/bin/pymolcas(注意不要删这个目录下其他东西),检查/usr/share/openmolcas如果没用的话也删掉。最后在/home/chan/下重装一遍,装前建议仔细、反复阅读《离线安装OpenMolcas-v22.06
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-8-26 22:40:46 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢老师!

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