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[辅助/分析程序] 求助:ABCluster作业系统提交相关问题

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本帖最后由 Ekko777 于 2022-9-13 16:03 编辑

提交文件在windows系统试过没有问题,在超算提交作业系统上提交脚本如下,运行开始后很快就结束,out文件里什么都没有,没有任何结果,求各位大佬帮忙看一下。

202209131603326617..png (22.44 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

202209131603326617..png

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发表于 Post on 2022-9-13 17:04:41 | 只看该作者 Only view this author
nohup.out有输出吗?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-13 19:49:11 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-9-13 17:04
nohup.out有输出吗?

没有输出,刚开始计算立马停止了,应该是脚本的问题。

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发表于 Post on 2022-9-13 19:55:43 | 只看该作者 Only view this author
看看标准输出和标准报错文件有没有内容呢?
心之所向,日复一日,必有精进

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发表于 Post on 2022-9-13 20:17:46 | 只看该作者 Only view this author
是不是没有source量化或第一性原理的程序?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-13 20:51:09 | 只看该作者 Only view this author
含光君 发表于 2022-9-13 19:55
看看标准输出和标准报错文件有没有内容呢?

都没有内容,现在

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-13 20:52:14 | 只看该作者 Only view this author
joeson 发表于 2022-9-13 20:17
是不是没有source量化或第一性原理的程序?

考虑是脚本上少了一部分东西,因为刚开始做模拟计算有很多不太懂的地方,能具体说一下吗,谢谢啦。

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发表于 Post on 2022-9-13 23:33:20 | 只看该作者 Only view this author
例如你要ABCluster与g09联用去搜索极小点,你要source /XX/XX/g09/bsd/g09.profile,以执行Gaussian自带的脚本文件,其中包含了各种配置Gaussian运行环境的命令。其他软件也是类似,也就是类似g09 <xx.gjf> xx.log这个命令能运行。你说没有任何输出,那么我认为要么geom没有执行权限,要么.inp输入文件中要调用的量化程序有问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-15 09:25:16 | 只看该作者 Only view this author
joeson 发表于 2022-9-13 23:33
例如你要ABCluster与g09联用去搜索极小点,你要source /XX/XX/g09/bsd/g09.profile,以执行Gaussian自带的 ...

谢谢老师,我是在超算上安装的abcluster,起初的尝试所以没有与高斯连用,直接用xtb进行的优化。如果像您说的是geom没有执行权限,这种应该如何去解决。

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发表于 Post on 2022-10-22 11:02:46 | 只看该作者 Only view this author
请问你解决了吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-26 09:54:24 | 只看该作者 Only view this author

没有解决,我现在用window版本的来跑,你也是有类似问题吗

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发表于 Post on 2022-10-31 11:00:26 | 只看该作者 Only view this author
Ekko777 发表于 2022-10-26 09:54
没有解决,我现在用window版本的来跑,你也是有类似问题吗

我的问题好像是开发者的geom脚本里面的语法不适用于我的超算系统~我也解决不了

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